unix的问题：使用sed合并两行

我有一个无法解决的奇怪问题。我使用下面的bash脚本在unix上将两行合并在一起。但是，第一行的最后一列与第二行的第一列合并（没有空格）。有人能帮忙吗

sed 'N;s/\n/  /' input.txt >> output.txt

输入：

chr6    108930289   108930461   GWNJ-0842:521:GW1906282259th:8:1101:11373:39475:GCCAAGsize=1
HPV45   5328    5400    GWNJ-0842:521:GW1906282259th:8:1101:11373:39475:GCCAAGsize=1
chr3    153084969   153085002   GWNJ-0842:521:GW1906282259th:8:1101:14560:33322:GCCAATsize=6
HPV45   4014    4219    GWNJ-0842:521:GW1906282259th:8:1101:14560:33322:GCCAATsize=6

输出：（例如，HPV45附加到其前面的1）

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您可以使用

awk

作为替代方案

此脚本保存每个奇数编号的输入行（从1开始），并为每个偶数编号的行打印保存的行（不带行分隔符）和当前行：

awk 'NR%2 {save=$0;}
!(NR%2) {print save,$0;}' input.txt >> output.txt

下一个脚本依赖于行首的模式

chr

或

HPV

，而不是使用行号：

awk '/^chr/ {save=$0;} 
/^HPV/ {print save,$0;}' input.txt >> output.txt

根据问题的输入，两个脚本都会生成以下输出：

chr6 108930289 108930461 GWNJ-0842:521:GW1906282259:8:1101:11373:39475:GCCAAGsize=1 HPV45 5328 5400 GWNJ-0842:521:GW1906282259:8:1101:11373:39475:GCCAAGsize=1
chr3 153084969 153085002 GWNJ-0842:521:GW1906282259:8:1101:14560:33322:GCCAATsize=6 HPV45 4014 4219 GWNJ-0842:521:GW1906282259:8:1101:14560:33322:GCCAATsize=6

备注：
如果总行数为奇数，基于行号的脚本将忽略最后一行。

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如果输入不总是包含成对的匹配行，则基于模式的脚本将产生错误的结果。

您可以使用

awk

此脚本保存每个奇数编号的输入行（从1开始），并为每个偶数编号的行打印保存的行（不带行分隔符）和当前行：

awk 'NR%2 {save=$0;}
!(NR%2) {print save,$0;}' input.txt >> output.txt

下一个脚本依赖于行首的模式

chr

或

HPV

，而不是使用行号：

awk '/^chr/ {save=$0;} 
/^HPV/ {print save,$0;}' input.txt >> output.txt

根据问题的输入，两个脚本都会生成以下输出：

chr6 108930289 108930461 GWNJ-0842:521:GW1906282259:8:1101:11373:39475:GCCAAGsize=1 HPV45 5328 5400 GWNJ-0842:521:GW1906282259:8:1101:11373:39475:GCCAAGsize=1
chr3 153084969 153085002 GWNJ-0842:521:GW1906282259:8:1101:14560:33322:GCCAATsize=6 HPV45 4014 4219 GWNJ-0842:521:GW1906282259:8:1101:14560:33322:GCCAATsize=6

备注：
如果总行数为奇数，基于行号的脚本将忽略最后一行。

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如果输入不总是包含成对的匹配行，则基于模式的脚本将产生错误的结果。

您好，谢谢您的评论。它不允许我附加txt文件。我从输入和输出中粘贴了几行。这有用吗？你试过sed'N；s/\r\n/'文件？你好，Oguz，谢谢回复。我尝试了这个，并在网上找到了几个不同的选择。第二行保留在第二行中，只有一个空格被添加到它之前。我能够真正合并这两行的唯一方法是使用代码，最终将文本合并在一起。如果您能想到其他任何东西，请让我知道，我会尝试一下。

od-c./input

显示了

size=1

和

HPV45

之间的内容？例如，当我使用您的示例输入运行它时，我看到

size=1\n hpv

Hi Seige，谢谢。是的，它也为输入文件显示了相同的内容。然而，在输出文件中，它显示了SIZE=1 H P VHi mevets，感谢您的评论。它不允许我附加txt文件。我从输入和输出中粘贴了几行。这有用吗？你试过sed'N；s/\r\n/'文件？你好，Oguz，谢谢回复。我尝试了这个，并在网上找到了几个不同的选择。第二行保留在第二行中，只有一个空格被添加到它之前。我能够真正合并这两行的唯一方法是使用代码，最终将文本合并在一起。如果您能想到其他任何东西，请让我知道，我会尝试一下。

od-c./input

显示了

size=1

和

HPV45

之间的内容？例如，当我使用您的示例输入运行它时，我看到

size=1\n hpv

Hi Seige，谢谢。是的，它也为输入文件显示了相同的内容。然而，在输出文件中，它显示了size=1hpvthanks！当我在仅复制上面发送的两行而生成的输出文件上运行此命令时，它对我不起作用。我正在使用Mac上的终端来做这件事，如果它改变了什么。这可能是Mac上使用分隔符的问题吗？问题是其他的awk代码对我也不起作用。@neginValizadegan“对我不起作用”的确切意思是什么？由于注释不是为此而设计的，请编辑您的问题，显示输入、您使用的确切命令以及结果输出。正如其他人已经写过的，您可能有错误或不一致的行尾引起的问题。请同时显示

od-c input.txt

和

od-c output.txt

的结果。如果您的文件长度超过几行，请使用类似于

head-4input.txt | od-c

的方法，这一个最终对我有效。不是为什么一开始没有。谢谢！：awk'NR%2{save=$0；}！（NR%2）{打印保存，$0；}'input.txt>>output.txt谢谢！当我在仅复制上面发送的两行而生成的输出文件上运行此命令时，它对我不起作用。我正在使用Mac上的终端来做这件事，如果它改变了什么。这可能是Mac上使用分隔符的问题吗？问题是其他的awk代码对我也不起作用。@neginValizadegan“对我不起作用”的确切意思是什么？由于注释不是为此而设计的，请编辑您的问题，显示输入、您使用的确切命令以及结果输出。正如其他人已经写过的，您可能有错误或不一致的行尾引起的问题。请同时显示

od-c的结果