Unix 如何使用特定的'；中点'；

我正在寻找一种在UNIX中简单地更改序列头名称的块顺序的方法

我现在拥有的序列名称是：

>PIENAPT00000000258_pienapg00000000172

但我需要：

>pienapg00000000172_PIENAPT00000000258

我试图用sed来实现这一点，但意识到这不是我要走的路。但不幸的是，目前还没有找到解决办法。有人能帮我吗

sed -E 's/PIENAPT.+\_pienapg.+/pienapg.+\_PIENAPT.+//' 

---

请您具体使用

sed

尝试以下内容

sed 's/\([^_]*\)\(_\)\(.*\)/\3\2\1/'  Input_file

或者，如果输入文件的行开头有

，由于引号标记而不清楚，请尝试以下操作

sed 's/\(^>\)\([^_]*\)\(_\)\(.*\)/\1\4\3\2/'  Input_file

awk 'BEGIN{FS=OFS="_"} {print substr($1,1,1)$2,substr($1,2)}' Input_file

或者根据@potong sir的评论，尝试：

sed -E 's/>(.*)_(.*)/>\2_\1/'  Input_file

---

---

相信我，使用

awk时这应该很容易

awk 'BEGIN{FS=OFS="_"} {print $2,$1}'  Input_file

或者，如果输入文件的行开头有

，由于引号标记而不清楚，请尝试以下操作

sed 's/\(^>\)\([^_]*\)\(_\)\(.*\)/\1\4\3\2/'  Input_file

awk 'BEGIN{FS=OFS="_"} {print substr($1,1,1)$2,substr($1,2)}' Input_file

---

请您具体使用

sed

尝试以下内容

sed 's/\([^_]*\)\(_\)\(.*\)/\3\2\1/'  Input_file

或者，如果输入文件的行开头有

，由于引号标记而不清楚，请尝试以下操作

sed 's/\(^>\)\([^_]*\)\(_\)\(.*\)/\1\4\3\2/'  Input_file

awk 'BEGIN{FS=OFS="_"} {print substr($1,1,1)$2,substr($1,2)}' Input_file

或者根据@potong sir的评论，尝试：

sed -E 's/>(.*)_(.*)/>\2_\1/'  Input_file

---

---

相信我，使用

awk时这应该很容易

awk 'BEGIN{FS=OFS="_"} {print $2,$1}'  Input_file

或者，如果输入文件的行开头有

，由于引号标记而不清楚，请尝试以下操作

sed 's/\(^>\)\([^_]*\)\(_\)\(.*\)/\1\4\3\2/'  Input_file

awk 'BEGIN{FS=OFS="_"} {print substr($1,1,1)$2,substr($1,2)}' Input_file

---

使用

和

作为带awk的字段分隔符：

awk 'BEGIN{FS="[>_]"}{print ">" $3 "_" $2}' file

输出：

>pienapg00000000172_PIENAPT00000000258 >pienapg00000000172\U PIENAPT00000000258

---

使用

和

作为带awk的字段分隔符：

awk 'BEGIN{FS="[>_]"}{print ">" $3 "_" $2}' file

输出：

>pienapg00000000172_PIENAPT00000000258 >pienapg00000000172\U PIENAPT00000000258

---

也许

sed-E的/>（.*）\u（.*）/>\ 2\u1/'文件

会更清晰？@poton，谢谢你，现在在我的帖子中添加了这个解决方案，干杯。也许

sed-E的/>（.*）\u（.*）/>\ 2\u1/'文件

会更清晰？@poton，谢谢，现在在我的帖子中添加了这个解决方案，干杯。