使用awk拆分多个列

使用awk拆分多个列,awk,Awk,我需要拆分一个包含多个列的文件,如下所示: TCONS_00000001 q1:Ovary1.13|Ovary1.13.1|100|32.599877 q2:Ovary2.16|Ovary2.16.1|100|88.36 TCONS_00000002 q1:Ovary1.19|Ovary1.19.1|100|12.876644 q2:Ovary2.15|Ovary2.15.1|100|365.44 TCONS_00000003 q1:Ova

我需要拆分一个包含多个列的文件,如下所示:

TCONS_00000001       q1:Ovary1.13|Ovary1.13.1|100|32.599877      q2:Ovary2.16|Ovary2.16.1|100|88.36
TCONS_00000002       q1:Ovary1.19|Ovary1.19.1|100|12.876644      q2:Ovary2.15|Ovary2.15.1|100|365.44
TCONS_00000003       q1:Ovary1.19|Ovary1.19.2|0|0.000000         q2:Ovary2.19|Ovary2.19.1|100|64.567
所需产出:

TCONS_00000001       Ovary1.13.1     32.599877      Ovary2.16.1     88.36
TCONS_00000002       Ovary1.19.1     12.876644      Ovary2.15.1     365.44
TCONS_00000003       Ovary1.19.2     0.000000       Ovary2.19.1     64.567
我的尝试:

awk 'BEGIN {OFS=FS="\t"}{split($2,two,"|");split($3,thr,"|");print $1,two[2],two[4],thr[2],thr[4]}' in.file
问题:

我有更多的列要拆分,如2和3,我希望找到比逐个拆分每个列更短的解决方案。

$#借用@Inian的答案的简单性;)
$ # borrowing simplicity from @Inian's answer ;)
$ awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"}
       {for(i=2; i<=NF; i++){split($i,a,/[:|]/); $i=a[3] "\t" a[5]}} 1' ip.txt
TCONS_00000001  Ovary1.13.1 32.599877   Ovary2.16.1 88.36
TCONS_00000002  Ovary1.19.1 12.876644   Ovary2.15.1 365.44
TCONS_00000003  Ovary1.19.2 0.000000    Ovary2.19.1 64.567

$ # previous solution which leaves tab character at end
$ awk -F'\t' '{printf "%s\t",$1;
             for(i=2; i<=NF; i++){split($i,a,/[:|]/); printf "%s\t%s\t",a[3],a[5]};
             print ""}' ip.txt
TCONS_00000001  Ovary1.13.1 32.599877   Ovary2.16.1 88.36   
TCONS_00000002  Ovary1.19.1 12.876644   Ovary2.15.1 365.44  
TCONS_00000003  Ovary1.19.2 0.000000    Ovary2.19.1 64.567  
$awk'开始{FS=OFS=“\t”} {for(i=2;i
$#借用@Inian的答案的简单性;)
$awk'开始{FS=OFS=“\t”}
{for(i=2;iWhile很好,如果您计划对一组记录执行冗余操作,建议使用函数并在每个记录上运行它

我将编写一个
awk
脚本,如下所示

#!/usr/bin/env awk

function split_args(record) {
    n=split(record,split_array,"[:|]")
    return (split_array[3]"\t"split_array[n])
}

BEGIN { FS=OFS="\t" }

{
    for (i=2;i<=NF;i++) {
       $i=split_args($i)
    }
    print
}
一个丑陋的命令行版本是

awk 'function split_args(record) {
         n=split(record,split_array,"[:|]")
         return (split_array[3]"\t"split_array[n])
     } 
     BEGIN { FS=OFS="\t" }    
     {
        for (i=2;i<=NF;i++) {
            $i=split_args($i)
        }
        print
     }
' newfile
awk'函数拆分参数(记录){
n=split(记录,split_数组,“[:|]”)
返回(拆分数组[3]“\t”拆分数组[n])
} 
开始{FS=OFS=“\t”}
{
对于(i=2;iWhile很好,如果您计划对一组记录执行冗余操作,建议使用函数并在每个记录上运行它

我将编写一个
awk
脚本,如下所示

#!/usr/bin/env awk

function split_args(record) {
    n=split(record,split_array,"[:|]")
    return (split_array[3]"\t"split_array[n])
}

BEGIN { FS=OFS="\t" }

{
    for (i=2;i<=NF;i++) {
       $i=split_args($i)
    }
    print
}
一个丑陋的命令行版本是

awk 'function split_args(record) {
         n=split(record,split_array,"[:|]")
         return (split_array[3]"\t"split_array[n])
     } 
     BEGIN { FS=OFS="\t" }    
     {
        for (i=2;i<=NF;i++) {
            $i=split_args($i)
        }
        print
     }
' newfile
awk'函数拆分参数(记录){
n=split(记录,split_数组,“[:|]”)
返回(拆分数组[3]“\t”拆分数组[n])
} 
开始{FS=OFS=“\t”}
{

对于(i=2;我想
cat-in.file | tr'''.\t'.\t'.\awk
…帮助你的案例?我想
cat-in.file | tr'.\t'.\t'.\awk
…帮助你的案例?@Sundeep:我真的希望你坚持这一点,而不是在
perl
中添加一个不可理解的答案)给你:
perl-F'-F'-lane'print-join'.\t',$F[0],map(split/[:]“
:)第一次这样做:D@Sundeep:这个很简单,但我永远不会学习这个构造
map
和其他构造,它们似乎永远不会结束是的,除非你喜欢修补这些东西……但后来我在python中学习了列表理解/map/lambda,然后在perl中了解了map/grep/etc;)现在学习一下ruby,它也有map.@Sundeep:我真的希望你坚持这一点,而不是在
perl
;)中添加一个不可理解的答案。现在开始:
perl-F'\t'-lane'print join“\t”,$F[0],map{(split/[:|]/[2,-1]}@F[1..$\F]“
:)第一次这样做:D@Sundeep:这个很简单,但我永远不会学习这个结构
map
和其他结构,它们似乎永远不会结束是的,除非你喜欢修补这些东西…但后来我在python中学习了列表理解/map/lambda,然后在perl中了解了map/grep/etc;)没有我们学习了一点ruby,它也有map。。