如何使用awk按行获取唯一字符的计数?
我有一个如下所示的文本文件:如何使用awk按行获取唯一字符的计数?,awk,Awk,我有一个如下所示的文本文件: A A A G A A A A A A A A G A G A G G A G G G G G G A A A A A T C T C C C A A A G A A C C C C C C T G G G G G T T T T T T 我想按行计算每个字母出现的次数。有相当多的文档是按字段而不是按行执行的。我一直在想: 对于(i=1;i我不太熟悉awk,这里有一个perl版本: perl -ne 'my %c; $c{$_}++ for split; prin
A A A G A A
A A A A A A
G A G A G G
A G G G G G
G A A A A A
T C T C C C
A A A G A A
C C C C C C
T G G G G G
T T T T T T
我想按行计算每个字母出现的次数。有相当多的文档是按字段而不是按行执行的。我一直在想:
对于(i=1;i我不太熟悉awk,这里有一个perl版本:
perl -ne 'my %c; $c{$_}++ for split; print scalar keys %c'
输出
212222212
如果愿意,可以添加换行符
perl -ne 'my %c; $c{$_}++ for split; print scalar keys %c . "\n"'
编辑
作为对评论的回应,也许这更像你的意思:
perl -ne 'my %c; $c{$_}++ for split; print "$_:$c{$_} " for keys %c; print "\n"'
输出:
A:5 G:1
A:6
A:2 G:4
A:1 G:5
A:5 G:1
T:2 C:4
A:5 G:1
C:6
T:1 G:5
T:6
在awk中,我认为没有一种更简单的方法可以迭代一行中的字段
awk '
{
delete a
for (i=1; i<=NF; i++)
a[$i]++
printf("%d -- ", NR)
for (val in a)
printf("%s:%d, ", val, a[val])
print ""
}
'
如果您将FS
字段分隔符设置为换行符'\n'
,是否可以使用您找到的文档轻松解答?这将计算不同字母的数量,而不是每个字母出现的次数。
1 -- A:5, G:1,
2 -- A:6,
3 -- A:2, G:4,
4 -- A:1, G:5,
5 -- A:5, G:1,
6 -- C:4, T:2,
7 -- A:5, G:1,
8 -- C:6,
9 -- G:5, T:1,
10 -- T:6,