如何在多个文件上使用awk（每个文件的第一个字段）并获得每个输入文件的结果

我尝试了

ls*.fasta | parallel--gnu“awk'{print$1}'>{/}.outputfile.txt”

它并没有产生我所需要的结果。我有48个文件，我需要提取这些字段并将它们输出到48个独立的文件中

我可以很好地运行它，但我必须对每个文件逐一执行：

awk'{print$1}'BLAST\u output\u file.txt>ID\BLAST\u output\u file.txt

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有人能帮我吗？谢谢你刚刚写了一个简单的bash脚本

for i in *.txt; do
    awk '{print $1}' $i > $i.id.blast.out.txt
done

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你能试试下面的吗

awk '{if(FILENAME!=prev){close(prev)};print $1;prev=FILENAME}'  *.fasta > output_all_file

如果您需要不同的输出文件（从您的尝试中看到）：

添加{}：

ls *.fasta | parallel --gnu "awk '{print $1}' {} > {/.}.outputfile.txt"

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您不需要使用for循环，您可以在awk本身中读取文件。看到这一次太确定了，很高兴它帮助你看到了这一链接一次，通过查看你的个人资料，你几乎无法选择任何答案作为正确答案，所以请在某个时候给出你的问题，当你有足够的答案时，试着选择其中一个作为正确答案。这似乎不适用于我的另一个文件。本质上是一个表，其中每个字符串由5个空格分隔。当我在一个文件上运行awk时，它能够很好地抓取第一列。当我在.tab文件上运行上述脚本时，它只是重新复制了该文件。为什么它在并行运行时会这样做？感谢“awk”部分是否独立工作（即没有GNU并行）？如果没有，那就先让它起作用。同时发布一个MCVE。这让帮助你变得容易多了。这对我所做的一切都有效。再次感谢！实际上，在10个左右的文件之后，我得到一个错误，即打开的文件太多。@user3105519，实际上我已经通过关闭文件来处理它了

ls *.fasta | parallel --gnu "awk '{print $1}' {} > {/.}.outputfile.txt"