Bash 匹配两个文件的第一列中的值，并将匹配行连接到新文件中
我需要在file1.txt中查找第1列（$1）中的字符串与file2.txt中第1列（$1）中的字符串的匹配项。然后我想在新文件中加入匹配的行Bash 匹配两个文件的第一列中的值，并将匹配行连接到新文件中,bash,awk,grep,match,Bash,Awk,Grep,Match,我需要在file1.txt中查找第1列（$1）中的字符串与file2.txt中第1列（$1）中的字符串的匹配项。然后我想在新文件中加入匹配的行 cat file1.txt 1050008 5.156725968 8.404038296 124.9198605 3.23E-21 2.33E-17 38.57865782 3310747 5.631470026 8.581936875 124.6039122 3.34E-21 2.33E-17 38.55204806 5910
cat file1.txt
1050008 5.156725968 8.404038296 124.9198605 3.23E-21 2.33E-17 38.57865782
3310747 5.631470026 8.581936875 124.6039122 3.34E-21 2.33E-17 38.55204806
5910451 4.900364671 8.455329195 124.5720603 3.35E-21 2.33E-17 38.54935989
730156 5.565210738 8.48792701 122.2168789 4.28E-21 2.33E-17 38.34773989
cat file2.txt
4230037 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00071 ILMN_333646 ERCC-00071 ERCC-00071
1050008 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00009 ILMN_333584 ERCC-00009 ERCC-00009
5260356 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00053 ILMN_333628 ERCC-00053 ERCC-00053
3310747 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00144 ILMN_333719 ERCC-00144 ERCC-00144
5910451 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00003 ILMN_333578 ERCC-00003 ERCC-00003
1710435 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00138 ILMN_333713 ERCC-00138 ERCC-00138
1400612 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00084 ILMN_333659 ERCC-00084 ERCC-00084
730156 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00017 ILMN_333592 ERCC-00017 ERCC-00017
out.txt
1050008 5.156725968 8.404038296 124.9198605 3.23E-21 2.33E-17 38.57865782 1050008 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00009 ILMN_333584 ERCC-00009 ERCC-00009
3310747 5.631470026 8.581936875 124.6039122 3.34E-21 2.33E-17 38.55204806 3310747 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00144 ILMN_333719 ERCC-00144 ERCC-00144
5910451 4.900364671 8.455329195 124.5720603 3.35E-21 2.33E-17 38.54935989 5910451 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00003 ILMN_333578 ERCC-00003 ERCC-00003
730156 5.565210738 8.48792701 122.2168789 4.28E-21 2.33E-17 38.34773989 730156 ILMN Controls ILMN_Controls ERCC-00017 ILMN_333592 ERCC-00017 ERCC-00017
如果您有一个解决方案，我将非常感谢您能简要解释一下这些步骤，因为我对这一点非常陌生。如果您不介意输出按第一列排序，那么您可以使用以下命令调用：
awk 'BEGIN {
FS = OFS = "\t"
}
NR == FNR {
# while reading the 1st file
# store its records in the array f
f[$1] = $0
next
}
$1 in f {
# when match is found
# print all values
print f[$1], $0
}' file1 file2
join check here:或here:+1获取一个好的脚本。但是，如果在任一文件的第一列中出现空格，或者其中一行中缺少该字段，并且OP明确指出某些字段缺少值，那么您应该使用awk'BEGIN{FS=OFS=“\t”}…”
，以确保安全。这是一个很好的解决方案。有没有一种简单的方法来处理某些文件缺少行的情况？@IsaacTurner如果其中一个文件缺少行，这种方法应该可以工作，您有什么问题？@cmh我想填写缺少的值-我找到了这个问题的解决方案
join <(sort file1.txt) <(sort file2.txt) >out.txt