Bash 遍历Ubuntu 16中的文件夹文件

我正在尝试遍历特定文件夹中的一些文件，以便对每个文件执行特定操作（使用神经成像工具FSL）

当我这样做的时候

$ find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/

它返回该文件夹中所有文件的列表

所以我做了

$  for i in 'find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/';do /usr/share/fsl/5.0/bin/bet $i ${i}_brain -f 0.4 -g 0;done

但结果是

Error: input image find not valid

我在CentOS 7中就可以做到这一点，所以我猜这可能是问题的根源

您需要一个shell glob：

您需要一个shell glob：

---

使用

-exec

选项

查找

：

find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/ -exec /usr/share/fsl/5.0/bin/bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;

对于喜欢将代码分散在多行的用户：

find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/ \
    -exec /usr/share/fsl/5.0/bin/bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;

例子 假设我们有一个包含以下文件的目录：

$ find .
.
./dir1
./dir1/file2
./dir1/file1

我们可以对这些文件中的每个文件运行

echo

命令，显示文件名已正确替换为命令：

$ find . -exec echo bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;
bet . ._brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1 ./dir1_brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1/file2 ./dir1/file2_brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1/file1 ./dir1/file1_brain -f 0.4 -g 0

如果您只想在常规文件而不是目录上运行命令，请添加

-type f

测试：

$ find . -type f -exec echo bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;
bet ./dir1/file2 ./dir1/file2_brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1/file1 ./dir1/file1_brain -f 0.4 -g 0

---

使用

-exec

选项

查找

：

find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/ -exec /usr/share/fsl/5.0/bin/bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;

对于喜欢将代码分散在多行的用户：

find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/ \
    -exec /usr/share/fsl/5.0/bin/bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;

例子 假设我们有一个包含以下文件的目录：

$ find .
.
./dir1
./dir1/file2
./dir1/file1

我们可以对这些文件中的每个文件运行

echo

命令，显示文件名已正确替换为命令：

$ find . -exec echo bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;
bet . ._brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1 ./dir1_brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1/file2 ./dir1/file2_brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1/file1 ./dir1/file1_brain -f 0.4 -g 0

如果您只想在常规文件而不是目录上运行命令，请添加

-type f

测试：

$ find . -type f -exec echo bet {} {}_brain -f 0.4 -g 0 \;
bet ./dir1/file2 ./dir1/file2_brain -f 0.4 -g 0
bet ./dir1/file1 ./dir1/file1_brain -f 0.4 -g 0

---

您的脚本应进行以下调整：

IFS=$'\n' for i in $(find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/)
do 
  /usr/share/fsl/5.0/bin/bet "$i" "${i}_brain" -f 0.4 -g 0
done

$（…）

语法用于作为单独的命令启动

find

，而不是创建字符串文字

'find…'

IFS
是分隔符，用于分割
find
返回的结果。我们必须更新它，否则带有空格的文件名将分别分配给
i

这里的答案说明了这一点。
您的脚本应该进行以下调整：

IFS=$'\n' for i in $(find /home/Desktop/MSc/ImagensMRI/T1/t1inciais/t1alzheimer/)
do 
  /usr/share/fsl/5.0/bin/bet "$i" "${i}_brain" -f 0.4 -g 0
done

$（…）
语法用于作为单独的命令启动
find
，而不是创建字符串文字
'find…'

IFS
是分隔符，用于分割
find
返回的结果。我们必须更新它，否则带有空格的文件名将分别分配给
i

这个答案解释了。
所有变量都缺少双引号。她名字中有空格的文件没有问题quoting@GillesQuenot正如我所说的：一次性脚本应该在所有文件名都是良性的假设下工作。OP使用了
$i
，没有引号，因此我假设文件的名称类似于
mriscan00001.png
到
mriscan12345.png
。但是是的，你是对的，它很脆。Veery脆性。不是一个不每次引用它们的好理由（除了int值）@GillesQuenot我希望这会稍微好一点？或者国际单项体育联合会做些有趣的事？是的，现在好多了。不需要在所有变量周围加双引号。她名字中有空格的文件没有问题quoting@GillesQuenot正如我所说的：一次性脚本应该在所有文件名都是良性的假设下工作。OP使用了
$i
，没有引号，因此我假设文件的名称类似于
mriscan00001.png
到
mriscan12345.png
。但是是的，你是对的，它很脆。Veery脆性。不是一个不每次引用它们的好理由（除了int值）@GillesQuenot我希望这会稍微好一点？或者国际单项体育联合会做些有趣的事？是的，现在好多了。不需要IFS@GillesQuenot抢手货用
$i
-->
{}
@GillesQuenot解决了这个问题。用
$i
-->
{}
修复。