在Bash中迭代文件并运行命令

我有一堆.sra文件，我想使用SRAtools中的fastq dump将其转换为.fastq格式。它们都存储在同一个目录中，所以我很想运行一个bash脚本来循环遍历它们，并使用各种方法应用fastqdump函数。但是，我不能完全正确地理解语法

#!/bin/bash
FILES=/home/sam/Documents/Reads
for file in FILES
do
[ fastq-dump "$file" ]
done

这将抛出“预期的一元运算符”。我相信这相当简单，但我是Bash脚本的初学者，不太清楚语法是如何工作的

---

谁能告诉我正确的语法吗？

去掉方括号。并将

文件

更改为

“$FILES”/*

，以便展开变量值并匹配该目录中的文件

#!/bin/bash
FILES=/home/sam/Documents/Reads
for file in "$FILES"/*
do
    fastq-dump "$file"
done

实际上，这个循环并不是必须的

fastq dump

可以采用多个文件名。你可以简单地写：

fastq-dump /home/sam/Documents/Reads/*

---

括号

[]

是用于测试的shell语法，其返回值（0表示true，非零表示false）旨在用作逻辑值，通常用于构建

if/then/else

块、循环终止条件或使用

&

和

|

逻辑运算符的条件执行。当你只想执行一个命令时，不要把它括在括号里。啊，好吧，第一种方法奏效了，我想还是学习如何在bash中使用循环更好。谢谢