MPI_reduce（），自定义数据类型包含动态分配的ARAY:分段错误

我不明白为什么当我使用包含动态分配数组的自定义MPI数据类型时，MPI_Reduce（）就会出现分段错误。有人知道吗？以下代码在MPI_Reduce（）内的2个处理器上崩溃。 但是，如果我删除了成员double*d int MyType并相应地更改了运算符和MPI类型例程，那么就不会出现任何问题

使用动态分配的阵列是否存在问题，或者我所做的工作是否存在根本性问题：

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <mpi.h>



typedef struct mytype_s
{
    int c[2];
    double a;
    double b;
    double *d;
} MyType;



void CreateMyTypeMPI(MyType *mt, MPI_Datatype *MyTypeMPI)
{
    int block_lengths[4];                        // # of elt. in each block
    MPI_Aint displacements[4];                   // displac.
    MPI_Datatype typelist[4];                    // list of types
    MPI_Aint start_address, address;            // use for calculating displac.
    MPI_Datatype myType;

    block_lengths[0] = 2;
    block_lengths[1] = 1;
    block_lengths[2] = 1;
    block_lengths[3] = 10;

    typelist[0] = MPI_INT;
    typelist[1] = MPI_DOUBLE;
    typelist[2] = MPI_DOUBLE;
    typelist[3] = MPI_DOUBLE;

    displacements[0] = 0;

    MPI_Address(&mt->c, &start_address);
    MPI_Address(&mt->a, &address);
    displacements[1] = address - start_address;

    MPI_Address(&mt->b,&address);
    displacements[2] = address-start_address;

    MPI_Address(&mt->d, &address);
    displacements[3] = address-start_address;

    MPI_Type_struct(4,block_lengths, displacements,typelist,MyTypeMPI);
    MPI_Type_commit(MyTypeMPI);
}




void MyTypeOp(MyType *in, MyType *out, int *len, MPI_Datatype *typeptr)
{
    int i;
    int j;

    for (i=0; i < *len; i++)
    {
        out[i].a += in[i].a;
        out[i].b += in[i].b;
        out[i].c[0] += in[i].c[0];
        out[i].c[1] += in[i].c[1];

        for (j=0; j<10; j++)
        {
            out[i].d[j] += in[i].d[j];
        }
    }
}




int main(int argc, char **argv)
{
    MyType mt;
    MyType mt2;
    MPI_Datatype MyTypeMPI;
    MPI_Op MyOp;
    int rank;
    int i;

    MPI_Init(&argc,&argv);
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&rank);


    mt.a = 2;
    mt.b = 4;
    mt.c[0] = 6;
    mt.c[1] = 8;
    mt.d = calloc(10,sizeof *mt.d);
    for (i=0; i<10; i++) mt.d[i] = 2.1;

    mt2.a = 0;
    mt2.b = 0;
    mt2.c[0] = mt2.c[1] = 0;
    mt2.d = calloc(10,sizeof *mt2.d);


    CreateMyTypeMPI(&mt, &MyTypeMPI);
    MPI_Op_create((MPI_User_function *) MyTypeOp,1,&MyOp);

    if(rank==0) printf("type and operator are created now\n");

    MPI_Reduce(&mt,&mt2,1,MyTypeMPI,MyOp,0,MPI_COMM_WORLD);

    if(rank==0)
    {




        for (i=0; i<10; i++) printf("%f ",mt2.d[i]);
        printf("\n");
    }

    free(mt.d);
    free(mt2.d);
    MPI_Finalize();

    return 0;
}

#包括
#包括
#包括
类型定义结构mytype\s
{
int c[2]；
双a；
双b；
双*d；
}MyType；
void CreateMyTypeMPI（MyType*mt，MPI\U数据类型*MyTypeMPI）
{
每个块中elt的int block_长度[4]；/#
MPI_Aint位移[4]；//位移。
MPI_数据类型类型列表[4]；//类型列表
MPI_Aint start_address，address；//用于计算显示。
MPI_数据类型myType；
块长度[0]=2；
块长度[1]=1；
块长度[2]=1；
块体长度[3]=10；
类型列表[0]=MPI_INT；
类型列表[1]=MPI\U双精度；
类型列表[2]=MPI\U双精度；
类型列表[3]=MPI\U双精度；
位移[0]=0；
MPI\U地址（&mt->c和&start\U地址）；
MPI\U地址（&mt->a和地址）；
位移[1]=地址-起始地址；
MPI_地址（&mt->b和&Address）；
位移[2]=地址-起始地址；
MPI_地址（&mt->d和地址）；
位移[3]=地址-起始地址；
MPI类型结构（4，块长度、位移、类型列表、MyTypeMPI）；
MPI_Type_commit（MyTypeMPI）；
}
void MyTypeOp（MyType*in，MyType*out，int*len，MPI_数据类型*typeptr）
{
int i；
int j；
对于（i=0；i<*len；i++）
{
out[i].a+=in[i].a；
out[i].b+=in[i].b；
out[i].c[0]+=in[i].c[0]；
out[i].c[1]+=in[i].c[1]；
对于（j=0；j让我们看看您的结构：

typedef struct mytype_s
{
    int c[2];
    double a;
    double b;
    double *d;
} MyType;

...

MyType mt;
mt.d = calloc(10,sizeof *mt.d);

以及您对此结构作为MPI类型的描述：

displacements[0] = 0;

MPI_Address(&mt->c, &start_address);
MPI_Address(&mt->a, &address);
displacements[1] = address - start_address;

MPI_Address(&mt->b,&address);
displacements[2] = address-start_address;

MPI_Address(&mt->d, &address);
displacements[3] = address-start_address;

MPI_Type_struct(4,block_lengths, displacements,typelist,MyTypeMPI);

问题是，此MPI结构只会应用于您在此处定义中使用的结构的一个实例。您对where
calloc（）完全没有控制权
决定从中获取内存；它可以位于虚拟内存中的任何位置。您创建和实例化的下一种类型，您的
d
数组的位移将完全不同；如果您使用
realloc（）更改数组的大小，甚至使用相同的结构
对于当前的
mt
，它可能最终会产生不同的位移

因此，当您使用这些类型之一发送、接收、减少或执行任何其他操作时，MPI库将尽职尽责地转到一个可能没有意义的位移，并尝试从那里读取或写入，这可能会导致SEGFULT

请注意，这不是MPI问题；在使用任何低级通信库时，或者在尝试从磁盘进行写/读时，都会遇到同样的问题

您的选项包括手动“编组”将数组放入消息中，无论是否包含其他字段；或者为d的位置添加一些可预测性，例如将其定义为某个已定义的最大大小的数组。
哦，我想我明白了：动态分配的内存块与我的结构的前几个成员不连续，但是MPI使用位移array，我给了他，试图访问成员“b”后的10 MPI_DOUBLE，这会导致分段错误。那么如何使用动态数组减少这种结构呢？您应该将MyType.d设置为数组。或者，如果您需要动态内存，则使用memcpy.Y创建一个包含结构内所有数据的内存包，并指向它es我需要数组是动态的，上面的代码是jsut的一个小例子，在我的实际代码中有许多大型数组因此需要动态分配。你能更具体地说明你对memcpy的建议吗？不要使用
memcpy
。MPI提供
MPI\u Pack
和
MPI\u Unpack
调用来执行端口可以将数据（非）打包到用户提供的内存缓冲区中。基本思想是自行构造消息，而不是创建数据类型，因为MPI根本无法遵循指针引用。
MPI\u Pack（）
和
MPI\u Unpack（）的组合
提供了执行便携式数据编组的方法。必须在调用
MPI\u Reduce（）
之前打包数据，并且自定义操作处理程序必须解压缩每个数据元素。