mex函数中单元数组和矩阵元素的索引和访问 我试图编写一个C++ MeX函数来迭代一个矩阵数组,每个矩阵的大小不同。在Matlab中,我可以使用以下代码完成此操作: function Z = myFunction(X, Z, B) for i = 1:size(X, 1) for j = 1:size(X, 2) for k = 1:size(X, 3) temp = X{i, j, k}; for m = 1:size(temp, 1) Z{temp(m, 1)}(temp(m, 2)) = Z{temp(m, 1)}(temp(m, 2)) + B(i, j, k); end end end end
这里X是一个三维单元数组,其中每个单元包含一个矩阵,该矩阵具有可变的行数和2列数。这两列允许我索引向量Z的另一个单元格数组,其中每个向量的长度不同。Z中索引的向量元素由三维矩阵B中的元素递增mex函数中单元数组和矩阵元素的索引和访问 我试图编写一个C++ MeX函数来迭代一个矩阵数组,每个矩阵的大小不同。在Matlab中,我可以使用以下代码完成此操作: function Z = myFunction(X, Z, B) for i = 1:size(X, 1) for j = 1:size(X, 2) for k = 1:size(X, 3) temp = X{i, j, k}; for m = 1:size(temp, 1) Z{temp(m, 1)}(temp(m, 2)) = Z{temp(m, 1)}(temp(m, 2)) + B(i, j, k); end end end end,c++,arrays,matlab,indexing,mex,C++,Arrays,Matlab,Indexing,Mex,这里X是一个三维单元数组,其中每个单元包含一个矩阵,该矩阵具有可变的行数和2列数。这两列允许我索引向量Z的另一个单元格数组,其中每个向量的长度不同。Z中索引的向量元素由三维矩阵B中的元素递增 到目前为止,我在C++中有以下代码(我以前从未用C++编码): #包括“mex.h” void MEX函数(int nlhs、mxArray*plhs[]、int nrhs、const mxArray*prhs[]) { 常量mxArray*X=prhs[0]; 常量mxArray*Z=prhs[1]; 常
到目前为止,我在C++中有以下代码(我以前从未用C++编码):
#包括“mex.h”
void MEX函数(int nlhs、mxArray*plhs[]、int nrhs、const mxArray*prhs[])
{
常量mxArray*X=prhs[0];
常量mxArray*Z=prhs[1];
常量mxArray*B=prhs[2];
常量int*pDims=mxGetDimensions(X);
mwSize nsubs=mxGetNumberOfDimensions(X);
对于(大小i=0;i
问题:
temp
的元素并像在Matlab代码中那样执行索引-由于所有输入数组都是常量
const
,因此您应该复制Z
-mxCalcSingleSubscript
可用于任何类型的阵列,包括单元阵列。在这里,我将其重命名为sub2ind
-mxGetPr
用于访问数组的元素
下面是一个实现(尚未在实际数据上测试):
#包括“mex.h”
#定义sub2ind mxCalcSingleSubscript
void MEX函数(int nlhs、mxArray*plhs[]、int nrhs、const mxArray*prhs[])
{
常量mxArray*X=prhs[0];
常量mxArray*Z=prhs[1];
常量mxArray*B=prhs[2];
mxArray*out=mxDuplicateArray(Z);
常量int*pDims=mxGetDimensions(X);
mwSize nsubs=mxGetNumberOfDimensions(X);
双*B_arr=mxGetPr(B);
对于(大小i=0;i
但是,MATLAB和c实现都可以更改为使用线性索引:
function Z = myFunction(X, Z, B)
for k = 1:numel(X)
for m = 1:size(X{k}, 1)
Z{X{k}(m, 1)}(X{k}(m, 2)) = Z{X{k}(m, 1)}(X{k}(m, 2)) + B(k);
end
end
end
#include "mex.h"
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[])
{
const mxArray* X = prhs[0];
const mxArray* Z = prhs[1];
const mxArray* B = prhs[2];
mxArray * out = mxDuplicateArray (Z);
mwSize n_X = mxGetNumberOfElements(X);
double* B_arr = mxGetPr(B);
for (size_t k = 0; k < n_X; k++) {
mxArray* temp = mxGetCell(X, k);
double* temp_arr = mxGetPr(temp);
const int* matDims = mxGetDimensions(temp);
size_t rows = matDims[0];
for (size_t m = 0; m < rows; m++) {
mwIndex temp_m_1 = temp_arr[m]-1;
mwIndex temp_m_2 = temp_arr[m+rows]-1;
double* Z_out = mxGetPr (mxGetCell(out,temp_m_1));
Z_out[temp_m_2] += B_arr[k];
}
}
plhs[0] = out;
}
function Z=myFunction(X,Z,B)
对于k=1:numel(X)
对于m=1:size(X{k},1)
Z{X{k}(m,1)}(X{k}(m,2))=Z{X{k}(m,1)}(X{k}(m,2))+B(k);
结束
结束
结束
#包括“mex.h”
void MEX函数(int nlhs、mxArray*plhs[]、int nrhs、const mxArray*prhs[])
{
常量mxArray*X=prhs[0];
常量mxArray*Z=prhs[1];
常量mxArray*B=prhs[2];
mxArray*out=mxDuplicateArray(Z);
mwSize n_X=mxGetNumberOfElements(X);
双*B_arr=mxGetPr(B);
对于(大小k=0;k
非常感谢您的宝贵意见!工作完美。我只是想知道,如果我删除X
、Z
和B
声明前面的const
,并将第27行和第33行中的out
替换为Z
,为什么Z
没有被修改?Z_out
现在不是指向Z
的元素而不是out
的元素,因此第28行直接修改Z
?这会比复制数组快吗?同样,避免使用mxCalcSingleSubscript
/sub2ind
和使用i
、j
、k
和m
直接索引X
和temp
会更快吗?mex函数的所有输入,包括X,Z和B是常数,必须/不能修改。因此,您应该创建一个副本并对其进行更改Z_out
指向out
WOW的元素,我希望我能给你更多的分数!我的代码现在快了7-10倍!非常感谢你!原始matlab。。。运行时间为1.767017秒。线性索引matlab。。。运行时间为0.880587秒。普通墨西哥。。。运行时间为0.577665秒。优化的mex。。。运行时间为0.220025秒。
#include "mex.h"
#define sub2ind mxCalcSingleSubscript
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[])
{
const mxArray* X = prhs[0];
const mxArray* Z = prhs[1];
const mxArray* B = prhs[2];
mxArray * out = mxDuplicateArray (Z);
const int* pDims = mxGetDimensions(X);
mwSize nsubs = mxGetNumberOfDimensions(X);
double* B_arr = mxGetPr(B);
for (size_t i = 0; i < pDims[0]; i++) {
for (size_t j = 0; j < pDims[1]; j++) {
for (size_t k = 0; k < pDims[2]; k++) {
int subs [] = {i, j, k};
mwIndex idx = sub2ind(X, nsubs, subs);
mxArray* temp = mxGetCell(X, idx);
double* temp_arr = mxGetPr(temp);
const int* matDims = mxGetDimensions(temp);
mwSize nsubs_temp = mxGetNumberOfDimensions(temp);
for (size_t m = 0; m < matDims[0]; m++) {
int subs_out_1 [] = {m,0};
int subs_out_2 [] = {m,1};
mwIndex temp_m_1 = temp_arr[sub2ind(temp, nsubs_temp, subs_out_1)]-1;
mwIndex temp_m_2 = temp_arr[sub2ind(temp, nsubs_temp, subs_out_2)]-1;
double* Z_out = mxGetPr (mxGetCell(out,temp_m_1));
Z_out[temp_m_2] += B_arr[idx];
}
}
}
}
plhs[0] = out;
}
function Z = myFunction(X, Z, B)
for k = 1:numel(X)
for m = 1:size(X{k}, 1)
Z{X{k}(m, 1)}(X{k}(m, 2)) = Z{X{k}(m, 1)}(X{k}(m, 2)) + B(k);
end
end
end
#include "mex.h"
void mexFunction(int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[])
{
const mxArray* X = prhs[0];
const mxArray* Z = prhs[1];
const mxArray* B = prhs[2];
mxArray * out = mxDuplicateArray (Z);
mwSize n_X = mxGetNumberOfElements(X);
double* B_arr = mxGetPr(B);
for (size_t k = 0; k < n_X; k++) {
mxArray* temp = mxGetCell(X, k);
double* temp_arr = mxGetPr(temp);
const int* matDims = mxGetDimensions(temp);
size_t rows = matDims[0];
for (size_t m = 0; m < rows; m++) {
mwIndex temp_m_1 = temp_arr[m]-1;
mwIndex temp_m_2 = temp_arr[m+rows]-1;
double* Z_out = mxGetPr (mxGetCell(out,temp_m_1));
Z_out[temp_m_2] += B_arr[k];
}
}
plhs[0] = out;
}