C++ Rcpp找不到gsl库

我没有主意了

我试图为R创建一个库，但我无法加载它

我得到的错误是

Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 
  unable to load shared object '/home/stenver/R/x86_64-pc-linux-gnu-    library/2.15/RcppWilcoxonTest/libs/RcppWilcoxonTest.so':
  /home/stenver/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/RcppWilcoxonTest/libs/RcppWilcoxonTest.so:     undefined symbol: gsl_cdf_gaussian_Q
Error: loading failed

我的Makevars文件如下所示：

PKG_LIBS = `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()" `

useDynLib(RcppWilcoxonTest)
useDynLib(gsl)
useDynLib(WilcoxonTest)

import(Rcpp)

export(RcppWilcoxonTest)

我试过改变里面的各种东西

我的命名空间文件如下所示：

PKG_LIBS = `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()" `

useDynLib(RcppWilcoxonTest)
useDynLib(gsl)
useDynLib(WilcoxonTest)

import(Rcpp)

export(RcppWilcoxonTest)

失败发生在我尝试使用的动态共享库中。我已经将动态库文件复制到src文件夹中，因此R将自己编译它们，但这没有用。理想情况下，我希望将库和Rcpp接口实现保存在单独的文件夹中

在某个时候，我也尝试使用RcppGSL，但它没有帮助，因为R在安装后找不到包

可以在此处看到整个存储库：

---

在rcppwilcoxonest文件夹中

您需要在

src/Makevars

文件中包含以下内容：；也就是说（借用

RcppGSL

做事的方式）：

所以R知道在编译包时需要链接GSL。有关更多详细信息，请参阅

---

通过检查如何配置

RcppGSL

来查找GSL，并在您的包中使用类似的方法，您可能会学到很多东西。

Kevin的回答可能会对您有所帮助，但事实上，有一个CRAN包明确地依赖于RcppGSL，我在其中做到了

edd@max:~/git/rcppziggurat/src$ cat Makevars
PKG_CPPFLAGS = -I. -I../inst/include
## Use the R_HOME indirection to support installations of multiple R version
PKG_LIBS = `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()"` \
           `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "RcppGSL:::LdFlags()"`
edd@max:~/git/rcppziggurat/src$ 

我在这里为展示画了一行

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本质上，RcppGSL调用了Kevin提到的相同的

gsl配置。
我试过Kevin和你的。在您的例子中，它只是说：在rcppwilcoxonest.cpp:1:0:./wilcoxonest.h:10:21:致命错误：RcppGSL.h:没有这样的文件或控制器。我完全按照你说的做了Makevars，还试着摸索。我还尝试将Import（RcppGSL）放到名称空间文件中。我还尝试将RcppGSL作为依赖项放在名称空间文件中。我需要了解-i和-L标志的作用，如果你不能掌握这一点，就学习一些更简单的东西。我在Rcpp书的第2章中的一个例子中慢慢地、详细地介绍了这一点。好的，谢谢，我会看看它们，尽管我相信我知道它们的含义。不幸的是，将它与R集成是我的要求之一。当您是cpp编译的初学者时，这不是最简单的任务，但我会想出一些办法。我也在考虑订购这本书，事实上我刚把它弄好。我从名称空间中删除了这些内容，甚至从Makevars文件中删除了所有内容，它只是。。作品我甚至重新启动了所有程序，以确保我没有意外地设置了一些随机变量。我最终使用了默认的gsl，因为我希望尽可能少地混合cpp和R—只需要一个方法调用。C++将在自己的共享库中进行繁重的操作。感谢您的快速响应和帮助，我在library.dynam（lib，package，package.lib）中发现一个错误：未找到共享对象“gsl.so”。我已经安装了gsl-dev。我的意思是-我在用GSL制作图书馆。我完全按照您所说的复制了内容，并在其中添加了“PKG_CPPFLAGS=-I.-I../inst/include”可能会提供一些信息。我最终没有使用RCPPPGSL，因为我不想混合R和C++代码，除了尽可能少的-只有一个方法调用。感谢您的帮助和快速响应。我不知道什么不起作用，因为现在我已经删除了NAMESPACE和makevar文件，它仍然在安装。我想你的答案更接近我的最终答案，所以格雷茨。我对它为什么开始工作感到困惑。。我想它会回来咬我，因为我不知道我为什么会被否决？