R 创建三状态马尔可夫链图

我有以下三种状态的数据框：愤怒、平静和疲惫。下面的数据框提供了一种状态转换为另一种状态的个别情况

pre<-cbind(c(rep("tired",100),rep("angry",100),rep("calm",100)))
post<-cbind(c(rep("tired",50),rep("angry",70),rep("calm",100),rep("tired",80)))
df<-cbind(pre,post)
df<-as.data.frame(df)
colnames(df)<-c("pre","post")

---

pre我们可以使用
markovchain
包，使用
diagram
中的
plot
方法

让我们首先根据您的
df

states<-c("tired","angry","calm")

probsCase<-function(i,j){
  sum(as.character(df$pre)==states[i] & as.character(df$post)==states[j])/sum(as.character(df$pre)==states[i])
}

transitionMatrix<-outer(1:3,1:3,Vectorize(probsCase))
colnames(transitionMatrix)<-states
rownames(transitionMatrix)<-states

编辑：

如果您在安装
markovchain
包时遇到问题，我们实际上不能使用它，而直接使用
diagram
包，它只需要
transitionMatrix

library(diagram)
plotmat(transitionMatrix,relsize=0.7)

然后，您可以使用
plotmat
中的选项根据自己的喜好调整外观。感谢您的回复，我成功地访问了transitionMatrix，但在安装程序包
markovchain
时遇到了问题，特别是它的依赖项
RCurl
。我有IR3.2.3版，运行在Crunchbang Linux Waldorf上。你是怎么安装的？你能至少把你的答案加起来，贴出情节的样子吗？再次感谢，谢谢！它可以工作，但由于某些原因，绘图的右边缘和上边缘超出了R图形设备。有没有办法将数字1、2和3替换为绘图中的“疲惫”、“愤怒”、“平静”状态？对于第一种状态，请更改
plotmat
中的
relsize
参数。第二步，需要重命名转换矩阵的行和列。编辑将播放一些技巧，有没有一种方法可以为绘图中的树状态圆添加颜色？@我想出来了，对于其他人来说，添加
box.col=c（“红色”、“绿色”、“蓝色”）
会起作用。再次感谢。
library(diagram)
plotmat(transitionMatrix,relsize=0.7)