使用CSV文件创建Neo4j数据库

我有2个

CSV

文件，我想将它们转换成

Neo4j

数据库。它们看起来像这样：

第一个文件：

name,enzyme
Aminomonas paucivorans,M1.Apa12260I
Aminomonas paucivorans,M2.Apa12260I
Bacillus cellulosilyticus,M1.BceNI
Bacillus cellulosilyticus,M2.BceNI

second file 

name,motif
Aminomonas paucivorans,GGAGNNNNNGGC
Aminomonas paucivorans,GGAGNNNNNGGC
Bacillus cellulosilyticus,CCCNNNNNCTC

如您所见，共同因素是生物体和动物的名称。每个

生物体

将有几个

酶

，每个

酶

将有1个

基序

<代码>基序在酶之间可以相同。我使用以下语句创建数据库：

USING PERIODIC COMMIT
LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file1.csv" AS csvLine
MATCH (o:Organism { name: csvLine.name}),(e:Enzyme { name: csvLine.enzyme})
CREATE (o)-[:has_enzyme]->(e) //or maybe CREATE UNIQUE?

USING PERIODIC COMMIT
LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file2.csv" AS csvLine
MATCH (o:Organism { name: csvLine.name}),(m:Motif { name: csvLine.motif})
CREATE (o)-[:has_motif]->(m) //or maybe CREATE UNIQUE?

这使我在

使用周期提交时在第一行出现错误，该行表示
无效输入“S”：应为
。如果我去掉了ti，我得到的下一个错误是在创建和加载CSV之间需要
WITH（第6行，第1列）
“匹配（o:organic{name:csvLine.name}），（m:Motif{name:csvLine.Motif}）”
。我在谷歌上搜索了这个问题，这让我想到了这一点。我尝试了给定的答案（刷新浏览器缓存），但问题仍然存在。我做错了什么？这个问题正确吗？这个问题还有别的解决办法吗？非常感谢您的帮助
您的查询同时有两个问题：

不能仅用“file1.csv”引用本地文件，因为neo4j需要一个URL
您正在使用
MATCH
以防数据最初可能不存在；您需要在那里使用
MERGE
，这与您添加的create unique注释基本相同
我不知道您的特定错误消息的来源是什么，但正如所写的，这些查询看起来不可能工作。以下是重新格式化的查询，以便它们能够正常工作（我使用您的CSV示例在我的机器上进行了测试）

注意这里的3个合并语句（
merge
基本上是
匹配的
+
CREATE
，如果它还不存在），以及我使用了一个
文件的事实：
URL

第二个查询的表述方式基本相同：

USING PERIODIC COMMIT
LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file:/home/myuser/tmp/file2.csv" AS csvLine
MERGE (o:Organism { name:  coalesce(csvLine.name, "No Name")})
MERGE (m:Motif { name: csvLine.motif})
MERGE (o)-[:has_motif]->(m);

编辑我在生物体的
名称
属性中添加了
合并
。如果CSV中
name
的值为空，则查询将失败。Coalesce保证，如果
csvLine.name
为空，那么您将返回“No name”（无名称）。
您使用的是什么版本的Neo4j？我使用的是
2.1.3
版本
使用定期提交时仍然显示错误。我去掉了它以查看查询是否有效，但它显示错误
无法使用name
Ah的null属性值合并节点，因此错误消息表示CSV中的一个“name”值为null。将在一秒钟内更新答案…我在谷歌上搜索了这个问题，似乎创建质量节点通常会导致这个错误。我使用定期提交添加了
，并重新运行了查询，现在错误更详细了：
无法使用null属性值合并节点（处理第2行的URL“file:/Users/GAMER/Documents/Neo4j/csvs/name_enzyme.csv”时失败。似乎没有提交任何行。请注意，此信息可能不准确。）
我不确定我是否完全理解它作为文件路径的要求。它只要求URL吗？我使用了与您在回答中给出的格式完全相同的格式，但它说
无法加载资源
。我的路径看起来像
文件：Users/GAMER/Desktop/cypher/name\u enzyme.csv
让我们看看。
USING PERIODIC COMMIT
LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file:/home/myuser/tmp/file2.csv" AS csvLine
MERGE (o:Organism { name:  coalesce(csvLine.name, "No Name")})
MERGE (m:Motif { name: csvLine.motif})
MERGE (o)-[:has_motif]->(m);