Deep learning 无掩模的U-Net分割

Deep learning 无掩模的U-Net分割,deep-learning,image-segmentation,medical-imaging,Deep Learning,Image Segmentation,Medical Imaging,我不熟悉深度学习和语义分割 我有一个Dicom格式的医学图像(CT)数据集,其中我需要从图像中分割肿瘤和相关器官。我已经标记了我们的医生绘制的器官轮廓,我们称之为以Dicom格式存储的RT结构 据我所知,人们通常使用“面具”。这是否意味着我需要将rt结构中的所有轮廓结构转换为掩码?或者我可以直接使用RT结构(.dcm)中的信息作为输入 感谢您的帮助。有一个名为pydicom的特殊库,您需要先安装该库,然后才能实际解码并在以后可视化X射线图像 现在,因为你想应用语义分割,你想分割肿瘤,解决方案是创

我不熟悉深度学习和语义分割

我有一个Dicom格式的医学图像(CT)数据集,其中我需要从图像中分割肿瘤和相关器官。我已经标记了我们的医生绘制的器官轮廓,我们称之为以Dicom格式存储的RT结构

据我所知,人们通常使用“面具”。这是否意味着我需要将rt结构中的所有轮廓结构转换为掩码?或者我可以直接使用RT结构(.dcm)中的信息作为输入


感谢您的帮助。

有一个名为
pydicom
的特殊库,您需要先安装该库,然后才能实际解码并在以后可视化X射线图像

现在,因为你想应用语义分割,你想分割肿瘤,解决方案是创建一个神经网络,它接受一对
[图像,遮罩]
,其中,比如说,遮罩中的所有位置都是0,除了肿瘤所在的区域,用1标记;实际上,你的基本事实就是面具


当然,为此,您必须实现您的
CustomDataGenerator()
,它必须在每一步产生一批如上所述的
[图像,掩码]
对。

有一个名为
pydicom
的特殊库,您需要安装该库,然后才能真正解码并在以后可视化X射线图像

现在,因为你想应用语义分割,你想分割肿瘤,解决方案是创建一个神经网络,它接受一对
[图像,遮罩]
,其中,比如说,遮罩中的所有位置都是0,除了肿瘤所在的区域,用1标记;实际上,你的基本事实就是面具


当然,为此,您必须实现您的
CustomDataGenerator()
,它必须在每个步骤产生一批如上所述的
[图像,掩码]
对。

一般来说,
如果您创建一个掩码
,您可以使用深度学习模型(Unet)轻松地对其进行训练。另一方面,如果你不想包装一个掩码,你需要
创建一个自定义的数据生成器
&它会有点复杂。一般来说,
如果你创建一个掩码
,你可以用深度学习模型(Unet)轻松地训练它。另一方面,如果您不想将mask打包,则需要创建一个自定义数据生成器&它将有点复杂。