Dll 合并自定义CodeDOM引用

我需要一种方法来合并我的自定义DLL与我的CodeDOM输出自动时，它的建设。我考虑过使用ILMerge，但有更好的方法吗？

为什么要避免ILMerge？我并不是真的想避免它，只是问是否有更好的方法。。。