Error handling 带有通配符的工作程序

我想使用snakemake来控制fastq文件，但它显示： 工作人员：

目标规则不能包含通配符。请指定具体文件 或者没有通配符的规则

我写的代码是这样的

SAMPLE = ["A","B","C"]

rule trimmomatic:
    input:
        "/data/samples/{sample}.fastq"
    output:
        "/data/samples/{sample}.clean.fastq"
    shell:
        "trimmomatic SE -threads 5 -phred33 -trimlog trim.log {input} {output} LEADING:20 TRAILING:20 MINLEN:16"

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我是新手，如果有人知道，请告诉我。非常感谢

您可以执行以下操作之一，但您可能希望执行后一个操作

• 通过命令行显式指定输出文件名：

  snakemake  data/samples/A.clean.fastq
  

  这将运行规则来创建文件

  data/samples/A.clean.fastq

• 使用

  规则all

  指定要在Snakefile自身中创建的目标输出文件。要了解有关通过

  规则所有添加目标的更多信息

  SAMPLE_NAMES = ["A","B", "C"]
  
  rule all:
      input:
          expand("data/samples/{sample}.clean.fastq", sample=SAMPLE_NAMES)
  
  rule trimmomatic:
      input:
          "data/samples/{sample}.fastq"
      output:
          "data/samples/{sample}.clean.fastq"
      shell:
          "trimmomatic SE -threads 5 -phred33 -trimlog trim.log {input} {output} LEADING:20 TRAILING:20 MINLEN:16"
  

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在您的帮助下，我已经解决了问题，非常感谢您！