Fortran 使用MPI从gfortan切换到ifort

我用fortran编写了一段代码，使用MPI进行并行化，我一直使用gfortran作为编译器，但现在我想使用Intel iFortran。问题是，在服务器上，我尝试为mpif90运行gnu编译器，但gnu编译器设置为默认值：

mpif90 --showme
gfortran -I/usr/lib/openmpi/include -pthread -I/usr/lib/openmpi/lib -L/usr//lib -L/usr/lib/openmpi/lib -lmpi_f90 -lmpi_f77 -lmpi -ldl -lhwloc

我不知道iPort中必须包含哪些标志。我是这样试的：

ifort -openmp test_mpi.f -I/usr/local/openmpi-1.8.4-intel/include -I/usr/local/openmpi-1.8.4-intel/lib -L/usr/local/openmpi-1.8.4-intel/lib -lmpi_f90 -lmpi_f77 -lmpi

这给了我一个输出：

/usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.7/../../../../lib//libmpi_f77.so: undefined reference to `opal_uses_threads'

然后，我尝试使用/usr/lib/OpenMpi/，而不是英特尔OpenMpi，程序可以编译，但在执行时，我得到：

./a.out: error while loading shared libraries: libiomp5.so: cannot open shared object file: No such file or directory

这是有线的，因为查找echo$LD_LIBRARY_路径：

/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/compiler/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/mpirt/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/ipp/../compiler/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/ipp/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/compiler/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/lib/intel64:/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/tbb/lib/intel64/gcc4.4

在/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/compiler/lib/intel64中有“libiomp5.so”

有人知道如何修复我的编译器标志吗

@高性能标记： 我现在是这样做的：

ifort -openmp test_mpi.f -I/opt/intel/mpi-rt/4.1.0/include -I/opt/intel/mpi-rt/4.1.0/lib -L/opt/intel/mpi-rt/4.1.0/lib -lmpi_f90 -lmpi_f77 -lmpi

这给了我：

ld: skipping incompatible /opt/intel/mpi-rt/4.1.0/lib/libmpi.so when searching for -lmpi ld: skipping incompatible /opt/intel/mpi-rt/4.1.0/lib/libmpi.a when searching for -lmpi

通过跳过

-lmpi

错误：

include -I/opt/intel/mpi-rt/4.1.0/lib -L/opt/intel/mpi-rt/4.1.0/lib -lmpi_f90 -lmpi_f77 ld: /tmp/ifort41PQRn.o: undefined reference to symbol 'mpi_null_delete_fn_' ld: note: 'mpi_null_delete_fn_' is defined in DSO /usr/lib/libmpi.so.1 so try adding it to the linker command line /usr/lib/libmpi.so.1: could not read symbols: Invalid operation

---

出现了

您需要首先设置编译器变量。英特尔为该任务提供了一个脚本：

/bin/compilervars.sh intel64

。然后所有的库都应该被找到，代码将被编译…@AlexanderVogt:对不起，我现在得到了它！我做到了：

/opt/intel/composer_xe_2015.1.133/bin/compilervars。”intel64'

有效。我用：

ifort-openmp test\u mpi.f-I/usr/lib/openmpi/include-I/usr/lib/openmpi/lib-L/usr/lib/openmpi/lib-lmpi\u f90-lmpi\u f77-lmpi

编译了它，它再次给了我：

/a.out:加载共享库时出错：libiomp5.so:无法打开共享对象文件：执行时没有这样的文件或目录

。我会重新下载询问HPC系统管理员是否支持使用模块选择OMPILER和mpi版本。“这要简单得多！”高性能马克和弗拉基米尔：我两个都做了，而且我让它运行起来了！问题是$PATH和$LD_LIBRARY_PATH没有指向英特尔编译器。感谢您应该始终使用为相应编译器安装或使用相应编译器编译的MPI库。通常，

/usr/lib

中的库是用

gcc

编译的，可能与英特尔编译器不兼容。您应该询问您的系统管理员，使用哪个版本（正如@VladimirF指出的，最好使用模块系统）。