Git合并具有不同文件结构的分支

我有一个关于重新构造git文件结构和新旧结构之间合并的问题。“导入分支”用于将源文件从另一个verion控制系统移动到git“new_layout”是对git中源文件3的重新构造

'import_branch'     ->      'new_layout'
- app/file1.txt     ->      - application/file1.txt
- fw/file2.txt      ->      - system/fw/file2.txt

我所做的：

• 在“进口分公司”中提交所有内容
• 已将文件复制到“新建布局”（清理存储库）
• git签出“新布局”
• git mv应用程序
• 吉特mv fw系统/fw

现在我想将“导入分支”中的更改合并到“新建布局”

• git签出“导入分支”
• 假设文件app/file1.txt发生了更改
• 提交“导入分支”中的更改
• git签出“新布局”
• git cherry pick-x（最新的“导入分支”提交SHA）

这样一来，“app/file1.txt”中的更改将合并为“application/file1.txt”

问题

但是，如果我在“import_branch”中添加一个新文件，比如说：“fw/file3.txt”，这将成为“new_layout”分支中的“fw/file3.txt”，而不是“system/fw/file3.txt”。指向新文件结构的链接未被保留

如何让git在合并期间跟踪新旧文件结构

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提前感谢

您不能引入一个新的提交来将所有文件重命名到新位置吗？否则，您可以修改合并提交，将所有剩余文件移动到新位置。谢谢您的回答。这当然可能是一个解决方案。但是，我有一个相当大的文件树，每天都在旧的SCM系统中添加/编辑新文件。所以我希望有一个解决方案，我不必做很多手动操作。。。