用Git合并/注入部分代码

好吧，我不相信有人问过这个问题，尽管类似的事情已经发生了。尽管如此，我还是会尽我所能清晰地传达整个概念

我在GIT中有一个主程序，由另一个团队更新，我无法控制他们如何更新该程序。我将此程序称为Source.pgm

现在，我对Source.pgm实现了一系列更改，希望将这些更改放入它们自己的存储库中。这些更改不能“运行”，因为它们只是转换更改，因此不是完全功能的程序。因此，这些更改不包含在特定的目录或模块中，它们只是将Source.pgm修改为utclimate.pgm。如前所述，这些更改分散在source.pgm的源代码中，但我想创建一个单独的存储库，只保存这些更改（以及任何未来的更改），这样当source.pgm发生更改时，我所需要做的就是“合并”/“注入”更改source.pgm的部分，并使其成为最终的.pgm（在完全覆盖的地方，其他地方修改代码行，甚至在其他地方添加新项目）——在运行此“合并”之前，我当然会检查Source.pgm发生了哪些更改因此，我确信他们的更改不会影响与Ultimate.pgm相关的任何内容，如果他们调整了Ultimate.pgm的转换代码段以适应这些更改，那么大多数情况下，这些更改不会影响Ultimate.pgm，直接“合并”/“注入”就可以了

现在我会用子模块来做这件事吗？我正在阅读这篇文章，但我不确定这是否允许我做这件事，因为他们似乎在谈论将完全自治的包（如库、模块等项目）制作成子模块，在子模块中，我所做的更改，如我所述，更改/修改某些文件中的某些代码行，完全覆盖（替换）其他几个文件，并在source.pgm的源代码中的许多地方添加几个全新的文件，然后将其转换为Ultimate.pgm

如果子模块不是我要做的事情，那么GIT是否还有另一个特性可以让我做到这一点。我知道我可以编写一个脚本，将我的更改“注入”到source.pgm的源代码中，但我希望我可以用GIT中的一些东西来完成这一切

提前谢谢