从R:Java版本missmatch调用h2o时连接失败
从R:Java版本missmatch调用h2o时连接失败,java,r,macos,h2o,Java,R,Macos,H2o,h2o以前在我的笔记本电脑上工作,但我有一段时间没有使用它 (同时安装了新的软件包并进行了更新)。昨天我试着用它,但没用。我删除了打包的Rh2o并重新安装了h2o install.packages("h2o") 我试着用h2o.init()运行h2o,但它给了我这个错误 java version "9" Java(TM) SE Runtime Environment (build 9+181) Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 9+181, mi
h2o
以前在我的笔记本电脑上工作,但我有一段时间没有使用它
(同时安装了新的软件包并进行了更新)。昨天我试着用它,但没用。我删除了打包的R
h2o
并重新安装了h2o
install.packages("h2o")
我试着用h2o.init()
运行h2o
,但它给了我这个错误
java version "9"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 9+181)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 9+181, mixed mode)
Starting H2O JVM and connecting: ............................................................
[1] "localhost"
[1] 54321
[1] TRUE
[1] -1
[1] "Failed to connect to localhost port 54321: Connection refused"
% Total % Received % Xferd Average Speed Time Time Time Current
Dload Upload Total Spent Left Speed
0 0 0 0 0 0 0 0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 0curl: (7) Failed to connect to localhost port 54321: Connection refused
[1] 7
Error in h2o.init() : H2O failed to start, stopping execution.
当我查看错误日志时,它显示
Only Java 1.6-1.8 supported, version is 9
我试图寻找更多信息,我认为错误是由第1836行触发的:
if (version != null && !(version.startsWith("1.6") || version.startsWith("1.7") || version.startsWith("1.8"))) {
System.err.println("Only Java 1.6-1.8 supported, version is " + version);
return true;
因此,似乎h2o
正在检查以1.6、1.7和1.8开头的版本,但出于某种原因,我的版本以9开头!
然而,在终端上,java-version
给出
openjdk version "1.8.0_121"
OpenJDK Runtime Environment (Zulu 8.20.0.5-macosx) (build 1.8.0_121-b15)
OpenJDK 64-Bit Server VM (Zulu 8.20.0.5-macosx) (build 25.121-b15, mixed mode)
/Users/myusername/anaconda3/bin/java
Matching Java Virtual Machines (4):
9, x86_64: "Java SE 9" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.jdk/Contents/Home
1.8.0_144, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_144.jdk/Contents/Home
1.8.0_51, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_51.jdk/Contents/Home
1.8.0_25, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_25.jdk/Contents/Home
以及java给出的
openjdk version "1.8.0_121"
OpenJDK Runtime Environment (Zulu 8.20.0.5-macosx) (build 1.8.0_121-b15)
OpenJDK 64-Bit Server VM (Zulu 8.20.0.5-macosx) (build 25.121-b15, mixed mode)
/Users/myusername/anaconda3/bin/java
Matching Java Virtual Machines (4):
9, x86_64: "Java SE 9" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.jdk/Contents/Home
1.8.0_144, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_144.jdk/Contents/Home
1.8.0_51, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_51.jdk/Contents/Home
1.8.0_25, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_25.jdk/Contents/Home
------------编辑-------
更多信息:/usr/libexec/java_home-V
提供
openjdk version "1.8.0_121"
OpenJDK Runtime Environment (Zulu 8.20.0.5-macosx) (build 1.8.0_121-b15)
OpenJDK 64-Bit Server VM (Zulu 8.20.0.5-macosx) (build 25.121-b15, mixed mode)
/Users/myusername/anaconda3/bin/java
Matching Java Virtual Machines (4):
9, x86_64: "Java SE 9" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.jdk/Contents/Home
1.8.0_144, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_144.jdk/Contents/Home
1.8.0_51, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_51.jdk/Contents/Home
1.8.0_25, x86_64: "Java SE 8" /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_25.jdk/Contents/Home
这解释了h2o
看到的9
。我觉得很奇怪,它期望1.x.0
,但版本只是9
。在任何情况下,我似乎需要将h2o.init()
命令指向1.8
java,但我不知道怎么做
我通常使用brew
安装大多数东西,但我从不使用java
,所以我对版本一无所知
谢谢你,祝你好运 您报告的错误显示: 仅支持Java1.6-1.8,版本为9 看起来您已经安装了Java9,H2O还不支持它。使用兼容的Java版本,这将修复错误 如果您不能或不想卸载Java 9,那么您需要通过设置
Java\u HOME
环境变量来告诉H2O您想要使用哪个Java。首先,通过在shell中执行以下命令来获取Java 1.8的位置:
/usr/libexec/java_home -v 1.8
在我的mac电脑上,它向我显示:
/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_45.jdk/Contents/Home
您可以通过运行以下命令检查R是否可以看到JAVA\u HOME
变量:Sys.getenv(“JAVA\u HOME”)
如果这是空的(如果您使用的是RStudio,则可能是空的),那么需要做更多的工作才能让R看到JAVA\u HOME
变量。您可以编辑~/.Renviron
文件以添加JAVA\u HOME=/Library/JAVA/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0\u 45.jdk/Contents/HOME
或计算机上的任何位置。然后重新启动RStudio,它应该会工作。我按照讨论内容找到问题的解决方案,尽管对某些人来说并不方便
默认的java
是1.8.x,因此一旦h2o
可以使用,但是从R
调用h2o
会导致调用版本9java
目前(相当零散的)解决方案是像这样从终端启动h2o
服务器
cd h2o-3.14.0.3 #navigate to wherever you have the h2o installation
java -jar h2o.jar
运行正常后,我从R
链接它,而不启动h2o
实例:
h2o.init(startH2O = FALSE)
如果您可以从终端启动
h2o
(这可能是您在集群上工作的唯一方法),那么这很好,但是如果您想立即从RStudio
启动它,那么这可能会很烦人。我显示了默认的java是“1.8.0\u 121”。不确定R从哪里得到版本9(注意,它看起来是版本9,而不是1.9,所以我想知道是否有问题)。好的,很抱歉我第一次错过了。我从您最近的编辑中看到,您安装了多个Javas。您可以修改或更新路径以选择Java 8吗?我将$Java_HOME改为指向/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_144.jdk/Contents/HOME
,但问题仍然存在。我不知道如何更改h2o
想要调用的java!您是否使用RStudio而不是命令行R?我注意到RStudio有时不会拾取环境变量。您可以通过检查Sys.getenv(“JAVA\u HOME”)
来查看R是否了解JAVA\u HOME
。如果为空,请尝试使用Sys.setenv(“JAVA_HOME”)
进行设置?这是一个在黑暗中射击,但可能会做的把戏…是的,这是关键!RStudio设计上不从.bashrc
读取环境变量(不知道原因是什么)。请编辑您的答案以包含以下信息,我将接受:)。首先,使用/usr/libexec/java_home-v1.8
获取1.8java的位置。其次,使用该位置编辑~/.Renviron
并添加JAVA\u HOME=your\u JAVA\u 1.8\u位置。重新启动RStudio,它就会工作!