Java 如何创建包含两个字段的自定义类列表并获得输出？

我需要在Java中列出一个基因序列，以及我关心的部分的起始位置。我使用一个.txt文件作为输入，然后按顺序搜索“GT”。一旦找到它，我想将它存储在一个具有相应索引的数组中。我不能让它发生。请引导我

import java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.IOException;
import java.nio.MappedByteBuffer;
import java.nio.channels.FileChannel;
import java.nio.charset.Charset;
import java.util.ArrayList;
import java.util.List;
import java.util.logging.Level;
import java.util.logging.Logger;


class Signal{
    public String signal;
    public int  pos;
    public Signal(String s, int p) {
        s = signal;
        p = pos;

    }


public static String inputSequence(String filename) throws IOException{


        FileInputStream stream = new FileInputStream(new File(filename));

        try {
            FileChannel fc = stream.getChannel();
            MappedByteBuffer bb = fc.map(FileChannel.MapMode.READ_ONLY, 0, fc.size());

    return Charset.defaultCharset().decode(bb).toString();

}
        finally{
            stream.close();
        }
    }
    public static void main(String[] args) {

     String c1 = "GT";
     String seq = null;
         List<Signal> s2 = new ArrayList<Signal>();
         String s1;
         int i;

         try {
            seq = inputSequence(path);
         } catch (IOException ex) {
            Logger.getLogger(Signal.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
         }
         for (i = 0; i < seq.length() - 2; i++ ) {
     s1 = seq.substring(i,i+2);
        if (s1.equals(c1)){

            Signal ss = new Signal(s1, i);
            s2.add(ss);

}

    }
         System.out.print(s2);

    }
}

导入java.io.File；
导入java.io.FileInputStream；
导入java.io.IOException；
导入java.nio.MappedByteBuffer；
导入java.nio.channels.FileChannel；
导入java.nio.charset.charset；
导入java.util.ArrayList；
导入java.util.List；
导入java.util.logging.Level；
导入java.util.logging.Logger；
类信号{
公共字符串信号；
公共int pos；
公共信号（字符串s，整数p）{
s=信号；
p=pos；
}
公共静态字符串输入序列（字符串文件名）引发IOException{
FileInputStream=新FileInputStream（新文件（文件名））；
试一试{
FileChannel fc=stream.getChannel（）；
MappedByteBuffer bb=fc.map（FileChannel.MapMode.READ_ONLY，0，fc.size（））；
返回Charset.defaultCharset（）.decode（bb.toString（）；
}
最后{
stream.close（）；
}
}
公共静态void main（字符串[]args）{
字符串c1=“GT”；
字符串seq=null；
列表s2=新的ArrayList（）；
字符串s1；
int i；
试一试{
seq=输入顺序（路径）；
}捕获（IOEX异常）{
Logger.getLogger（Signal.class.getName（））.log（Level.SEVERE，null，ex）；
}
对于（i=0；i

您的构造函数应如下所示：

public Signal(String s, int p) {
    signal = s;
    pos = p;
}

---

之后，它应该可以正常工作。

您可以在循环中使用

indexOf

查找所有出现的“GT”。如下所示：

 String c1 = "GT";
 String seq = null;
 List<Signal> s2 = new ArrayList<Signal>();

 try {
    seq = inputSequence(path);
 } catch (IOException ex) {
    Logger.getLogger(Signal.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
 }

 int index = seq.indexOf(c1, 0);
 do{
      if(index != -1){
          Signal ss = new Signal(c1, index);
          s2.add(ss);
          System.out.println(index);
      }
      index = seq.indexOf(c1, index+2);
 }while(index != -1);

 System.out.println(s2);

---

试着准确地解释什么是你不能工作的，这样人们就可以看到一个特定的问题。实际上，这个构建成功了，但我无法得到我想要的输出。我试图将其作为信号类的数组列表，我希望得到如下输出：[（GT，5），（GT，12），（GT，27）]，但是，我得到的是：[信号。Signal@42e816]我需要弄清楚在列表中存储两个字段（一个字符串，一个整数）多亏了dogbane，不能完全解释我的问题是我的错。我找到了所有的GT。然而，我试图将其作为信号类的arrayList，我希望得到如下输出：[（GT，5），（GT，12），（GT，27）]，但我得到的是：[信号。Signal@42e816]我有一个问题，dogbane，如果我想检查序列中的两个字符串，比如c1=“GT”c2=“ATG”，该怎么办您应该创建一个以c1为参数并返回信号列表的方法。然后你可以用“GT”来调用这个方法，然后再用“ATG”来调用。请你再帮我一点，我知道我的要求可能太高了，但我真的是一个编程新手，不擅长自我教育。谢谢AnshulGarg，但这并不能解决我的问题。在我对《罗布麻》的评论中，我做了更多的解释。

@Override
public String toString(){
    return "(" + signal + "," + pos + ")";
}