Java Nei Gojobori-Ka/Ks-dn/ds比率多个实施问题

下午好

我正在浏览Nei-Gojobori算法或Ka/Ks比率的实现——非同义和同义密码子变化之间的比率

我发现了三个实现，它们都声称是该算法的正确实现

实施1-

实施2-

实现3——我自己的版本是根据《计算基因组学导论》（Cristianini，Hahn）中的算法讨论编写的

运行实现2中的示例（Sequence1-GTTATGAACC；和Sequence2-GTACTGAAACC；），我得到以下结果：

执行情况1-1/6 实施2-0.12 实施3-0.0729751

实现2不考虑两个序列上同义和非同义位点的平均值

哪个实现是正确的？ 我想知道哪个是正确的程序，这样我就可以放大这个逻辑，允许>2个序列

谢谢，

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U.

我投票结束这个问题，因为它不是一个编程问题。这个问题的答案需要应用领域的知识，而不是编程知识。请投反对票，尽管我希望还有其他解决问题的程序员能够避免这种程度的迂腐。。。。我问的是用于解决特定问题的算法的逻辑，是的。如果你对编程的定义不包括使用算法，那么请随意投票反对这个问题。我想HPM的意思是，如果没有你提到的书中的算法，或者没有你对它的实现，我们就没有什么可以帮助你的了。就是这样。。。。。这与我的实现无关，实现3。我想知道我提出的另外两种方法1或2中的哪一种是正确的方法……您可能想降低障碍，并在这里发布这两种算法