Java系统调用中的Perl字符串

我在代码的开头定义了array@ID。我用这个id列表做不同的事情，因此我定义了

my$id仅在开头（I
使用严格；警告
）

也许我把问题简化得太多了，所以最后不清楚了

$cv
和
$smo
都是依赖于
$id
的，它们都是perl字符串。像这样：

.... 
for $id (@ID) { 

    $cv = $htotal{$id};
    $smo = $hsmote{$id};

    system('java -Djava.util.Arrays.useLegacyMergeSort=true weka.classifiers.meta.FilteredClassifier -t Projects/proteins/$id_MSA/$id_.arff -x $cv -s 0 -p 1,2 -distribution \
        -F "weka.filters.MultiFilter -F \" weka.filters.unsupervised.attribute.Remove -R 7,9\" -F \" weka.filters.unsupervised.attribute.RemoveType -T string\" \
        -F \"weka.filters.supervised.instance.SMOTE -C 0 -K 5 -P $smo -S 1\"" -W weka.classifiers.functions.MultilayerPerceptron -- -L 0.3 -M 0.2 -N 500 -V 0 -S 0 -E 20 -H 0 \
        > Projects/rbfs/$id.rbf');
}
...

为了确保没有Weka错误，我尝试了，例如cv=2，smo=100，id=P12345；它工作得很好，所以这是一个插值问题，正如你们中的一些人提到的

根据您提到的解决方案，我尝试了@nlu建议的双引号+{}：

system('java [...] -t Projects/proteins/"${id}"_MSA/"${id}"_.arff -x "${cv}" -s 0 -p 1,2 -distribution [...]    -F \"weka.filters.supervised.instance.SMOTE -C 0 -K 5 -P "${smo}" -S 1\"" [...] > Projects/rbfs/"${id}".rbf');

但没用，我写错了吗

与此相同（替换“``的
system（）
）无效：

java[…]-t Projects/150400_GSupdate/proteins/${id}{MSA/${id}.arff-x${cv}-s0-p1,2[…]-F\'weka.filters.supervised.instance.SMOTE-c0-k5-p${smo}-s[…]>Projects/150400_GSupdate/rbfs/${id}.rbf

最后对我起作用的是字符串连接（正如@Matt所建议的），但我确信所有其他选项也应该可以，尽管我不知道为什么不可以。
在Perl中调用函数时，如
system
在您的例子中，您可以使用
插值来替换字符串中的变量

要实现这一点，您需要以双引号传递字符串，因此首先必须用双引号替换周围的单引号

此外，为了消除字符串中出现的任何变量名称的歧义，您应该这样编写它们：

"${id}" 

避免混淆变量名，如
id
和
idsomething

此处记录：
不清楚其他变量是否是$id以外的shell变量？如果您只想替换$id，最简单的方法就是使用字符串连接：

for $id (@ID) {
    system('java -Djava.util.Arrays.useLegacyMergeSort=true weka.classifiers.meta.FilteredClassifier -t $PATH/proteins/$id_MSA/$id_.arff -x $cv -s 0 -p 1,2 -distribution \
        -F "weka.filters.MultiFilter -F \" weka.filters.unsupervised.attribute.Remove -R 7,9\" -F \" weka.filters.unsupervised.attribute.RemoveType -T string\" \
        -F \"weka.filters.supervised.instance.SMOTE -C 0 -K 5 -P $smo -S 1\"" -W weka.classifiers.functions.MultilayerPerceptron -- -L 0.3 -M 0.2 -N 500 -V 0 -S 0 -E 20 -H 0 \
        > $PATH/rbfs/' . $id . '.rbf');
}

如果希望将所有$something都视为perl变量，那么在系统字符串中使用“and\”最简单的方法可能是将system（）替换为``运算符，这基本上与system做相同的事情

for $id (@ID) {
    `java -Djava.util.Arrays.useLegacyMergeSort=true weka.classifiers.meta.FilteredClassifier -t $PATH/proteins/$id_MSA/$id_.arff -x $cv -s 0 -p 1,2 -distribution \
        -F "weka.filters.MultiFilter -F \" weka.filters.unsupervised.attribute.Remove -R 7,9\" -F \" weka.filters.unsupervised.attribute.RemoveType -T string\" \
        -F \"weka.filters.supervised.instance.SMOTE -C 0 -K 5 -P $smo -S 1\"" -W weka.classifiers.functions.MultilayerPerceptron -- -L 0.3 -M 0.2 -N 500 -V 0 -S 0 -E 20 -H 0 \
        > $PATH/rbfs/$id.rbf`;
}

另外，for循环应该使用一个局部变量，以便对我的$id（@id）{}
。这表明您没有在脚本顶部使用strict；use warnings；，这将帮助您避免常见问题。或者您正在从范围外重新使用$id，这不是一个好计划，除非您有充分的理由，而这看起来不像是一个好计划。