Java 如何搜索和汇总字符串；CTG“；在另一个字符串中，哪个是文件？

如何从读取为字符串的文件中搜索字符串CTG？然后数一数它出现了多少次？ 例如，我将如何在此处或任何地方添加代码来执行此操作：

public String readStrFromFile(){

    FileResource readFile = new FileResource();

    String DNA = readFile.asString();

    //System.out.println("DNA: " + DNA);

    return DNA;

}//end readStrFromFile() method;

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可以使用正则表达式

String DNA = readFile.asString();
Pattern pattern = Pattern.compile("CTG");
Matcher matcher = pattern.matcher(DNA);
while(matcher.find()){
    System.out.println(matcher.group() + " at " + matcher.start());
}

或者，如果文件太大，则应使用KMP算法或类似算法

编辑：
你可以有一个柜台

int count = 0; 
while(matcher.find()){
    count++;
    System.out.println(matcher.group() + " at " + matcher.start());
}
System.out.println("Number of count : " + count);

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我该如何计算所有这些CTG？我需要知道你们能用这个计数器做多少。