Javascript 用汉明距离d生成长度为l的字符串

我正在研究Motif搜索问题的一个变体，在其中一个子部分的逻辑上遇到了障碍

问题是：

你有字母表-['A'，'C'，'G'，'T']

现在，给你一个由这些字母组成的字符串数组，长度为L，距离为D

例如，如果我们取L=3，d=2，并给出数组[ACT，TGC，GTA]

对于数组中的每个字符串，我们必须使用汉明距离为d的字母表生成长度相同的字符串3。汉明距离d意味着，与原始字符串相比，如果d=2，则最终字符串将只有两个d编辑

因此，如果我们以数组中的ACT为例，我们必须生成GTT、AAG、CGT等等。 我想将这些生成的字符串存储在一个列表中

分解字符串的递归函数似乎是最有效的方法，但我在实现它时遇到了困难。关于用代码/伪代码解释的逻辑有什么想法吗？我需要能够把这个问题推广到L=15和d=5

汉明距离d=1的示例

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这可以让你开始。它不处理创建长度与源不同的字符串。也许你可以补充一下

JavaScript代码：

函数falpabet，str，前缀，i，d{ 如果d==0 返回[prefix+str.substri]； 让单词=[]； 对于设j=0；jd 单词=words.concat falphabet，str，前缀+str[i]，i+1，d 返回单词； } 常量字母表=['A'，'C'，'G'，'T']； const strs=[ACT、TGC、GTA]； 关于strs的let-str{ console.logstr； console.logJSON.stringifyfalphabet，str，0,2； console.log；

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} 这可以让你开始。它不处理创建长度与源不同的字符串。也许你可以补充一下

JavaScript代码：

函数falpabet，str，前缀，i，d{ 如果d==0 返回[prefix+str.substri]； 让单词=[]； 对于设j=0；jd 单词=words.concat falphabet，str，前缀+str[i]，i+1，d 返回单词； } 常量字母表=['A'，'C'，'G'，'T']； const strs=[ACT、TGC、GTA]； 关于strs的let-str{ console.logstr； console.logJSON.stringifyfalphabet，str，0,2； console.log；

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} 您可以应用以下类比来解决此问题：如果您必须同时更改两个符号和长度为15的子字符串。首先，将两个索引的所有组合制作成一组，范围从0到14。在python中，可以使用itertool函数来实现这一点。第二，根据所选符号创建两个符号的所有组合，本例中为gatc。接下来，迭代每个索引组合i：一组介于0-14之间的两个数字，并以嵌套方式迭代符号组合j：一组两个符号。在迭代中，如果与我选择的索引相对应的任何字符都不等同于对应符号j的组合，那么我们可以用j替换这些索引。这样，就可以获得字符串的所有邻居。此算法的时间复杂度为On

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您可以应用以下类比来解决此问题：如果您必须同时更改两个符号和长度为15的子字符串。首先，将两个索引的所有组合制作成一组，范围从0到14。在python中，可以使用itertool函数来实现这一点。第二，根据所选符号创建两个符号的所有组合，本例中为gatc。接下来，迭代每个索引组合i：一组介于0-14之间的两个数字，并以嵌套方式迭代符号组合j：一组两个符号。在迭代中，如果与我选择的索引相对应的任何字符都不等同于对应符号j的组合，那么我们可以用j替换这些索引。这样，就可以获得字符串的所有邻居。此算法的时间复杂度为On

Python函数从特定字符串生成距离为d的汉明字符串

函数生成具有汉明距离d的字符串 def gen_ham_stringsalphabets，string，前缀，i，d: 基本情况 如果d==0： 返回[前缀+字符串[i:] 单词=[] 对于字母表中的j： 如果字母[j]！=字符串[i]： 单词+=gen_ham_stringsalphabets，string，前缀+字母[j]，i+1，d-1 如果lenstring-i>d： 单词+=gen_ham_stringsalphabets，string，前缀+string[i]，i+1，d 回话 Python函数从特定字符串生成距离为d的汉明字符串

函数生成具有汉明距离d的字符串 def gen_ham_stringsalphabets，string，前缀，i，d: 基本情况 如果d==0： 返回[前缀+字符串[i:] 单词=[] 对于字母表中的j： 如果字母[j]！=字符串[i]： words+=gen_ha m_stringsalphabets，string，前缀+字母[j]，i+1，d-1 如果lenstring-i>d： 单词+=gen_ham_stringsalphabets，string，前缀+string[i]，i+1，d 回话

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Python代码即将发布…Python代码即将发布。。。。