在LinuxBash脚本中使用if和else检查目录名并分配变量

我正在创建（我认为是）一个简单的脚本来检查我当前的目录，其中包含了更多有名称的目录

SAMPLE_ANN-A10, SAMPLE_ANN-B4 etc.
SAMPLE_NEM-E7, SAMPLE_NEM-H2, etc.
SAMPLE_TODE-H02 etc. etc.

我想为每个示例分配一个查询变量并运行一个命令。所有TODE将使用相同的变量，所有NEM将使用相同的变量，所有ANN将使用相同的变量

这是我当前的脚本和错误消息。谢谢你的关注

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谢谢， 乔

双括号[[应该做这项工作]=>

for dir in $@
do
    QUERY=''
    if [[ $dir == SAMPLE_ANN* ]]
        then
            QUERY=annelids.fasta
    elif [[ $dir == SAMPLE_NEM* ]]
        then
            QUERY=nemertea.fasta
    else
        QUERY=nematode.fasta
    fi
    echo $QUERY #used to check if the variable was set correctly
done

ATM：您只是迭代所有给定参数，但据我所知，您希望迭代当前目录中的所有目录，这类似于：

for dir in ./*

还需要一些是直接检查。 另一种方法是使用find-like

find . -type d -depth 1 --execute yourscript {} \;

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find.-type d

将查找当前目录下的所有目录。若要仅查找当前目录中的目录，请使用深度参数：

find.-type d-depth 1--执行…

@StephenP谢谢。更新了答案。问题是

if

测试紧随其后的命令的退出代码；它正在尝试执行n

$dir

（不管该值是什么）作为一个命令，带有参数

=

和shell glob

示例的扩展。\u ANN*/

。您需要的是使用程序

test

，即/bin/test或shell内置，或用于测试的别名

[/code>（/bin/[或内置）或者，像SleepProgger一样，使用bash“关键字”
[[
（注意[[是不可移植的，但这通常不是问题，因为bash现在被广泛使用。）
for dir in $@
do
    QUERY=''
    if [[ $dir == SAMPLE_ANN* ]]
        then
            QUERY=annelids.fasta
    elif [[ $dir == SAMPLE_NEM* ]]
        then
            QUERY=nemertea.fasta
    else
        QUERY=nematode.fasta
    fi
    echo $QUERY #used to check if the variable was set correctly
done

for dir in ./*

find . -type d -depth 1 --execute yourscript {} \;