Linux下R包的安装位置逻辑
不同R包的不同安装位置背后的逻辑是什么?我似乎在linux机器上的几个不同位置安装了软件包。这是典型的行为吗?如果是,在Linux下R包的安装位置逻辑,linux,r,Linux,R,不同R包的不同安装位置背后的逻辑是什么?我似乎在linux机器上的几个不同位置安装了软件包。这是典型的行为吗?如果是,在/usr/lib/R/libraryvs/usr/lib/R/site library中安装软件包的理由是什么?我真的不在乎软件包安装在哪里,但在我的系统中把安装分散在不同的位置似乎有点傻 Renviron有下面的评论,这似乎表明/usr/lib/R/site library是针对Debian打包包的,但没有真正解释其他两个目录的用途。另外,通过将/usr/lib/R/libr
/usr/lib/R/library
vs/usr/lib/R/site library
中安装软件包的理由是什么?我真的不在乎软件包安装在哪里,但在我的系统中把安装分散在不同的位置似乎有点傻
Renviron
有下面的评论,这似乎表明/usr/lib/R/site library
是针对Debian打包包的,但没有真正解释其他两个目录的用途。另外,通过将/usr/lib/R/library
设置为列表中的最后一个,是否会使其不是install.packages()
的默认目录
马特
从特定版本(Debian/Ubuntu)到通用版本(所有Linux发行版)的概括方式是错误的
这个特别的设置是由两个使用R核心成员的Debian向我建议的(这是在Ubuntu出现之前)。这不是一个R范围的建议,这就是为什么您在手册中找不到它的原因,而是R高级用户提出的在Debian和类似Debian的系统上实施的具体建议
基本思想是
- 完全忠实于分离
,/usr/
。。。。一方面由包装管理系统(例如,/var/
,apt get
,…)处理,另一方面由用户处理:dpkg
等:这两个系统不得混合使用/usr/local/..
- 因此,
将获得由/usr/local/lib/R/site library
发出的列表中的第一个位置,并因此成为默认值,从而确保用户安装的软件包最终低于上一点所述的.libPaths()
/usr/local/
- 因此,在下面的
中,我们在/usr
中分离了推荐的R包(也包括在基本R源代码中:/usr/lib/R/library
,boot
,grid
,…),然后所有其他包管理控制lattice
下面的包r-cran-*
。例如,/usr/lib/r/site library
在那里结束,或者r-cran-xml
,或者r-cran-zoo
在多用户操作系统上,让所有用户都能使用本地软件包是个好主意。好的,谢谢。我想这可能是我作为一个相对较新的Linux(Ubuntu)用户没有理解的分裂的原因。
# edd Apr 2003 Allow local install in /usr/local, also add a directory for
# Debian packaged CRAN packages, and finally the default dir
> .libPaths()
[1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library"
[3] "/usr/lib/R/library"