Linux FORTRAN内存利用率-静态与动态

我有一个问题，我以前试图问，但没有走远，并找到了新的信息，我希望得到更多的帮助。该代码是一种混合的

MPI

/

OPENMP

代码，当尝试在多个节点上运行时，由于分段错误而崩溃（尽管如果它仅在一个节点上执行，即主进程产生的节点上执行，则该代码仍然有效）。问题中存在静态阵列，我发现如果静态阵列“太大”，则会导致seg故障，但如果它们“太小”，则一切正常。作为测试，我还将代码转换为动态内存分配，这解决了问题。。。无论大小（即使是在静态世界中失败的较大的代码），代码都可以正常运行到完成。这个解决方案不是长期的，因为测试代码只是。。。作为测试代码，有一个更大的代码表现出相同的行为，将其更改为动态不是一个选项。我需要确定导致静态阵列seg故障的原因

基本上，静态分配和动态分配内存的处理方式有什么区别？除了我尝试过的事情之外，我还应该尝试什么来克服这个问题？我认为问题与系统设置有关，可能只有当作业通过MPICH2时才发生冲突，但在登录到节点时不是问题（因此它在我当前登录的节点上运行良好）

在我的

.bashrc

文件中，我有“

ulimit-s unlimited

”、“

export-OMP\u STACKSIZE=4g

”和“

export-KMP\u STACKSIZE=4g

”，因为我使用的是ifort编译器。我相信这一定是一个相对简单的解决方案，但我无法做到

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如果需要违反程序源代码，我可以将其发送出去，但我认为这里给出的描述涵盖了问题，请告诉我

静态分配的东西出现在堆栈上，而动态分配的东西出现在堆上。这就是为什么小型静态阵列可以正常工作，而大型阵列则不能

由于您使用的是ifort编译器，因此可以尝试使用

-堆数组进行编译，但这只会将动态分配的数组放在堆上（ifort的独特之处在于，“临时”可分配数组可能会放在堆栈上，就像在子程序中分配的数组一样）

要检查的另一件事是，MPI作业实际上允许您设置堆栈大小。试着运行
mpirun-n ulimit-s
，它应该显示所有
unlimited
，否则它就不会尊重你的bashrc

您可以尝试bash脚本（myScript.sh），例如：

然后将与以下各项一起运行：

mpiexec -n <numprocs> myScript.sh

mpiexec-n myScript.sh
你找到了答案。问题在于，通过mpiexec调用时，shell值和.bashrc文件不会被转发/执行。4个节点的堆栈大小为“unlimited，819281928192”，第一个是我登录的节点。下一个问题是。。。如何解决这个问题？我可以通过mpiexec调用传递“ulimit-s unlimited”，但不知道语法。更好的是，我是否应该在集群的管理方面对此进行更改？（我必须将命令“ulimit-s”添加到一个文件中，并使该文件成为可执行文件，然后通过mpiexec传递该文件以使其工作）。我试图“投票”你的答案，但我没有足够的声誉或其他东西。抱歉。请注意，我必须使用可执行文件方法，因为发送“mpiexec-np 4-machinefile machines ulimit-s”失败，并且出现错误，我尝试的其他方法都是使用各种引号。我不知道如何在一个命令中发送所有内容而不导致错误。如何提交作业？qfiles还是手动？如果通过qfile，只需将
ulimit-s unlimited
放入qfile。否则，您的另一个选择是编写一个简单的批处理脚本，使用
mpiexec
运行该脚本，设置堆栈大小，然后执行exe。答案中有一个例子。如果你能在管理端更改它，那至少会起作用。但不受限制的堆栈大小也有缺点，特别是在多用户系统上。但是，如果保证只有你一个人在一个节点上运行，那么如果你把它吃光了，无限的堆栈大小就不会影响其他人的工作。
mpiexec -n <numprocs> myScript.sh