Linux RODBC无法识别我的odbc设置

我正在Red Hat Linux 6服务器上运行R2.15.2。我的目标是通过RODBC连接到另一台机器上的MS SQL Server数据库。我做了研究，从下载并安装了linux版本的MS SQL ODBC驱动程序。我必须从源代码处构建unixODBC 2.3.0版，因为它是windows驱动程序所必需的，并且还不在RHL repo中（repo版本是2.2.14）

无论如何，经过一点工作，我终于安装并正确配置了驱动程序，我可以通过

isql

命令成功连接到SQL Server数据库：

$ isql -v test testuser testpass
+---------------------------------------+
| Connected!                            |
|                                       |
| sql-statement                         |
| help [tablename]                      |
| quit                                  |
|                                       |
+---------------------------------------+
SQL>

所以我知道我已经正确设置了

odbc.ini

和

odbcinst.ini

文件

但是，当我尝试从R中访问ODBC连接时，会发生以下情况：

> test <- odbcDriverConnect('DSN=test;Database=RSQLTest01;Uid=testuser;Pwd=testpass')
Warning messages:
1: In odbcDriverConnect("DSN=test;Database=RSQLTest01;Uid=testuser;Pwd=testpass") :
   [RODBC] ERROR: state IM002, code 0, message [unixODBC][Driver Manager]Data 
   source name not found, and no default driver specified
2: In odbcDriverConnect("DSN=test;Database=RSQLTest01;Uid=testuser;Pwd=testpass") :
   ODBC connection failed

我一直在做一些研究，我认为解决方案（尽管我可能错了）可能与正确配置ODBC环境变量有关，以便RODBC知道在哪里可以找到

ODBC.ini

。根据我的研究，我发现了以下可能相关的环境变量：

$ODBCINI、$ODBCSYSINI、$ODBC\u ROOT$ODBC\u INCLUDE和$ODBC\u LIBS。

我对这些变量应该设置为什么有一个合理的想法，但我不确定如何永久设置它们，以便RODBC能够识别在哪里找到合适的文件

有人能帮我解释一下吗？我不确定自己是否正确理解了环境变量在linux中的工作方式，尤其是为什么

isql

在连接上没有问题，但是

RODBC

甚至找不到驱动程序/数据源

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注意：当我安装了unixODBC的repo版本时，使用R中的

install.packages（'RODBC'）

命令，RODBC安装会很好。但是，在我从源代码安装unixODBC 2.3.0之后，由于依赖性问题，RODBC安装会失败，我必须使用。有没有可能我一开始就没有正确配置ODBC，这就是我现在遇到麻烦的原因？

哇，我以为我是唯一一个处理这类东西的人。我必须解决同样的问题，发现最好的解决方案是使用rjdbc。这更容易配置，因为linux或osx上的ODBC非常不稳定。RJDBC的性能非常好，因为它使用本机ms sql server jar来执行查询。下面是我们其中一个脚本的一个示例。您只需要从microsoft下载sqljdbc4.jar，然后将.package（“RJDBC”）安装到您的环境中。我意识到您正在尝试让ODBC工作，我确实让它在osx上工作，但由于时间关系，我放弃了

library(RJDBC);  

drv <- JDBC('com.microsoft.sqlserver.jdbc.SQLServerDriver', '/usr/local/project/dataproviders/jdbc/sqljdbc4.jar', identifier.quote="'"); 

ch <- dbConnect(drv, 'jdbc:sqlserver://the.server.address.net;databaseName=DataWarehouse', 'USERNAME', 'PASSWORD'); 

allsupp_allprod_allproc <- dbGetQuery(ch, paste("SELECT  [Date], Sum([Fail]) as Numerator, Sum([Pass] + [Fail]) as Denominator,'' as Annotation,'True'  as 'Use for CL' FROM [PSU_YieldData] Group by [Date] Order by [Date]")); 

库（RJDBC）；
drv在Ubuntu服务器中，我这样设置



编辑~/.bash_配置文件

nano~/.bash\u配置文件

添加此行

导出ODBCINI=/usr/local/etc/odbc.ini
导出ODBCSYSINI=/usr/local/etc

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然后RODBC将很好地工作。

它找不到驱动程序，因为您没有指定它！我也不明白DSN的东西应该如何工作，但在类似的情况下，这对我来说是可行的：

ch <- odbcDriverConnect('driver={SQL Server};server=servername;database=databasename;uid=username;pwd=password;')
sqlQuery(ch,'sql script',stringsAsFactors = FALSE)

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我只是搜索“mysql odbc连接字符串”，而不是任何特定于R的内容。

在Mac OS 10.13.3上配置unixODBC后，我也遇到了这个问题。我尝试配置我的.Renviron为ODBCINI设置一个特定于R的环境变量，但RODBC仍然不会列出我的数据源名称（DSN）。此外，我无法让它找到ODBCinst.ini中指定的驱动程序，甚至无法获得使用RODBC:：ODBCDriverConnect（）的连接字符串，尽管我能够连接isql

我能够让JDBC连接正常工作，但我不想依赖JVM，我已经为RodbText编写了一个重要的数据库访问代码

最终起作用的只是：

remove.packages('RODBC')
install.packages('RODBC', type="source") 

如果您在mac上从源代码安装RODBC，它会正确地读取odbc.ini文件和odbcinst.ini文件

感谢这篇文章对解锁钥匙的微妙评论：

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即使在windows中，我也发现odbcDriverConnect语句很挑剔，以至于我从未让它工作过。相反，我使用odbcConnect（'odbc\u dsn\u entry'，uid='username'）。我知道ubuntu有一个odbc管理器，它看起来很像windows的管理器，但是它并没有提供更多的帮助，尤其是在红帽方面。此外，我在odbc管理器中将DB设置为用户和系统dsn方面也取得了更大的成功。非常感谢！！JDBC比ODBC简单得多它还不适用于我，但上面的一行也不适用（

isql-v testtestuser testpass

。我正在尝试与FileMaker连接：

ch@Bobby你应该试试RJDBC。你只需要下载并使用FileMaker JDBC驱动程序。
Driver={MySQL ODBC 5.1 Driver};Server=localhost;Database=myDataBase;User=myUsername;Password=myPassword;Option=3;

remove.packages('RODBC')
install.packages('RODBC', type="source")