如何让NumPy在Ubuntu中使用OpenBlas？

我安装了BLAS和OpenBLAS：

$ dpkg -l \*blas\* | grep ^i
ii  libblas-dev                                           1.2.20110419-7                                      amd64        Basic Linear Algebra Subroutines 3, static library
ii  libblas3                                              1.2.20110419-7                                      amd64        Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library
ii  libopenblas-base                                      0.2.8-6ubuntu1                                      amd64        Optimized BLAS (linear algebra) library based on GotoBLAS2
ii  libopenblas-dev                                       0.2.8-6ubuntu1                                      amd64        Optimized BLAS (linear algebra) library based on GotoBLAS2

然而，NumPy仍然表示OpenBLAS不可用：

>> np.__config__.show()
blas_info:
    libraries = ['blas']
    library_dirs = ['/usr/lib']
    language = f77
lapack_info:
    libraries = ['lapack']
    library_dirs = ['/usr/lib']
    language = f77
atlas_threads_info:
  NOT AVAILABLE
blas_opt_info:
    libraries = ['blas']
    library_dirs = ['/usr/lib']
    language = f77
    define_macros = [('NO_ATLAS_INFO', 1)]
atlas_blas_threads_info:
  NOT AVAILABLE
openblas_info:
  NOT AVAILABLE
lapack_opt_info:
    libraries = ['lapack', 'blas']
    library_dirs = ['/usr/lib']
    language = f77
    define_macros = [('NO_ATLAS_INFO', 1)]
atlas_info:
  NOT AVAILABLE
lapack_mkl_info:
  NOT AVAILABLE
blas_mkl_info:
  NOT AVAILABLE
atlas_blas_info:
  NOT AVAILABLE
mkl_info:
  NOT AVAILABLE

我怎样才能解决这个问题

我不认为我可以直接卸载

libblas3

，因为很多东西都依赖它，包括

libblas dev

，甚至

libopenblas dev

都依赖它

我试过了

$ sudo apt-get install --reinstall python-numpy

但这没用

这尤其令人惊讶，因为链接到OpenBLAS的

numpy

中的所有

*.so

文件：

$ ldd `find /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy -name \*\.so` | grep libblas
        libblas.so.3 => /usr/lib/libblas.so.3 (0x00007fba2ac96000)
        libblas.so.3 => /usr/lib/libblas.so.3 (0x00007f04f7f54000)
        libblas.so.3 => /usr/lib/libblas.so.3 (0x00007f9a941a9000)

$ ls -l /usr/lib/libblas.so.3 /etc/alternatives/libblas.so.3
lrwxrwxrwx 1 root root 35 Oct 22  2014 /etc/alternatives/libblas.so.3 -> /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3
lrwxrwxrwx 1 root root 30 Oct  6  2014 /usr/lib/libblas.so.3 -> /etc/alternatives/libblas.so.3

---

根据

ldd

输出，NumPy必须已经与OpenBLAS链接。它只是不知道它，因为它是通过

/usr/lib/libblas*

链接的，它认为它是通用的BLAS。

在Ubuntu 16.10上，你可以

$ apt install libopenblas-base

并使用

$ update-alternatives --config libblas.so.3

我做了，然后跑了

import numpy as np
a1 = np.random.rand(10000, 10000)
a2 = np.random.rand(10000, 10000)
np.dot(a1, a2)

使用libblas（2m38s，仅单芯负载）和libopenblas（0m18s，多芯负载）

---

编辑：这是通过Ubuntu的官方存储库安装的Python和numpy，而不是pip。

这个答案虽然被接受，但没有提到具体的解决方法。如何才能让NumPy“知道”它与OpenBLAS有关联？尽管我很好奇答案是什么，但这可能与我的情况无关。我的输出几乎与本文中的输出相同，除了一行提示这个被接受的解决方案-ldd'find/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy-name*\.所以在我的情况下，'| grep libblas在该目录中没有找到任何这样的文件。那么这对我来说意味着什么呢？最重要的是，我该怎么办？@Rafael_Espericueta就我而言，没有必要做任何事情。在您的情况下，假设您正确地描述了它，您甚至可能没有从apt安装python blas（我真的不想再次猜测您可能已经安装了python blas，或者您的目标是什么）