Operating system 生物信息学的最佳操作系统？
生物信息学工作的最佳操作系统选择是什么？大多数用于64位Windows、Linux/Unix或OS X的工具是什么？Unix系统在科学上非常流行，因此我建议使用Linux，特别是在计划使用FORTRAN时。您可以尝试Windows，但Windows API并不完全是程序员所熟悉的，而C#（虽然对于大多数应用程序来说速度非常快）对于科学计算来说可能太慢了。F#对科学来说确实很棒，但我不确定它是否足够快，可以进行复杂的计算Operating system 生物信息学的最佳操作系统？,operating-system,bioinformatics,Operating System,Bioinformatics,生物信息学工作的最佳操作系统选择是什么？大多数用于64位Windows、Linux/Unix或OS X的工具是什么？Unix系统在科学上非常流行，因此我建议使用Linux，特别是在计划使用FORTRAN时。您可以尝试Windows，但Windows API并不完全是程序员所熟悉的，而C#（虽然对于大多数应用程序来说速度非常快）对于科学计算来说可能太慢了。F#对科学来说确实很棒，但我不确定它是否足够快，可以进行复杂的计算 我猜你也可以使用C++、STL，或者一些与PLT无关的GUI工具包，比如QT
我猜你也可以使用C++、STL，或者一些与PLT无关的GUI工具包，比如QT或WxWIDGET。这样，您就不必担心平台（那么多）。因为这个领域的许多参与者都是大学，而且许多大学都使用Linux，这是我的猜测。我知道我的硕士学位是在那所学校的生物信息学系用Linux获得的。如果你使用流行的Linux发行版，比如Ubuntu，你会先加载Perl和（我相信）Python。这些是用于生物信息学的流行语言，并且有一些很好的库（Bioperl/biopython/CPAN/etc）
此外，我还没有使用过它，但它是为这类事情而设计的。虽然可能不是最好的操作系统，但有大量的Windows软件。在制药公司工作期间，我见过SAS、SPlus、StatXact、NQuery等公司
也就是说，越来越多的人转向Linux。例如，R编程可用于多个操作系统。我怀疑由于最终用户对系统的熟悉，渗透速度较慢。Mac OS X，您可以在虚拟机中安装Windows，并且是Unix。然后介绍Linux的所有优点（带有“端口”包管理程序）
就我的0.02美元。这是一个很难回答的问题。。。生物信息学分析可以从仅仅使用现有软件到开发自己的软件。因此，根据您想要完成的任务，将得到不同的答案。然而，Linux可能是您最好的选择，因为大多数生物信息学软件都需要从源代码处编译，并且可能是在Linux兼容平台上开发的。我当前的设置是一个运行Linux的Windows操作系统。通过这种方式，我获得了良好的硬件支持（Linux仍然有点缺乏），并能够使用我的研究所需的大量软件程序。对于bioinfo，Linux很好，但可能需要一些软件来进行数据分析。例如，在我的例子中，我必须通过adobe illustrator改进通过脚本生成的矢量图形图像。在这种情况下，完整的linux设置对我来说是不好的 对于服务器和运行程序（主要是perl脚本，就像bioinfo社区喜欢perl一样），我强烈支持Linux。任何其他Unix要么已经过时，要么很快就会过时
因此，我的建议是在服务器上安装Linux，在笔记本电脑上安装另一个Unix，以便具有更好的兼容性。由于唯一适合桌面的Unix解决方案是MacOSX，这就是您的问题的答案。在生物信息学和类似领域，您可以在工具集中进行选择，这些工具集通常涉及多个主机/来宾/目标操作系统。您使用的操作系统主要取决于您在何处/如何工作 我在许多不同的工作环境中工作过，从纯Linux到“纯”Windows（hel-lo Cygwin）。我从来没有在MacOSX上工作过，但也知道那些专门从事这项工作的人 如果你打算开发广泛发行的自由／开源软件应用程序，那么Linux、ANSI C、Perl/Python、Apache/MySQL（即LAMP堆栈）就是你的选择。此外，Windows和Cygwin也有类似的“WAMP”堆栈，有人可以编译和使用Linux开发的许多工具。据我所知，许多Linux应用程序也可以在Mac OS X上构建/运行
对于数据分析/可视化，流行的商业工具甚至许多OSS工具都在Windows中运行，可以是本机版本，也可以是Java版本。因此，最好的设置可能是一台本机Windows XP机器，并[xhosted]访问Linux的真实/虚拟实例。Windows是一个不错的选择，有很多非常标准的应用程序，您可能会想要，如AnnHyb、MeltSim、Base Pad和Winblast。看看Linux！！ 它不仅是一个操作系统，而且是一个由一群人生产和维护的软件项目，其各个部分（从内核到各种程序） 如果你长时间（一到两年）使用Linux，你将学会如何生活并为社区做出贡献，这对科学家来说是非常有用的 从技术角度来看，Linux是Unix系统的免费克隆，这意味着它可以很好地支持在命令行（bash）上工作，还可以使用许多工具来管理平面文件（sed、awk、grep），这将使您能够对文本文件执行操作，而无需直接打开它们。 此外，它有很好的工具，允许您管理系统中安装的程序，并通过单击下载和安装新程序。它可能缺少一些高级的专有程序，但另一方面，你有很多免费的工具和良好的文档
我已经使用Linux 4年了，我一点也不想念其他操作系统。我最近注意到MacBooks有了很大的转变。在最近的会议上，MacBook已经超越了linux或windows笔记本电脑。mac笔记本电脑的优点是，如果碰巧有些软件包不可用，您可以在shell中使用fink或类似工具在笔记本电脑上完成所有linux操作。你可以用笔记本电脑做其他非核心的工作。Windows应用程序使用Parallels或VMFusion-plus，并具有unity等功能，您无需运行完整的Windows虚拟机 在桌面方面，我可能仍然推荐linux。这是因为如果您开发任何类型的服务器基础设施，那么部署环境也一定是linux。服务器上的红帽在网络中很流行