Parallel processing 如何在一个PBS作业提交中运行多个命令

我写了一个只需要1-4个CPU的代码。但是，当我在集群上提交作业时，我必须至少使用一个节点，每个作业具有16个核心。因此，我想在提交的每个作业的每个节点上运行几个模拟。 我想知道是否有一种方法可以在一项工作中同时提交模拟

下面是一个例子：

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我的代码需要4个CPU。我为一个节点提交一个作业，我希望该节点运行我代码的4个实例（每个实例有不同的参数），以获取所有16个核心。

当然可以；通常，此类系统会有如何执行此操作的说明

如果您有（例如）4个4-cpu作业，并且（例如）希望它们在4个不同的目录中运行（以便更容易跟踪输出文件），请使用shell符号在后台分别运行它们，然后等待所有后台任务完成：

(cd jobdir1; myexecutable argument1 argument2) &
(cd jobdir2; myexecutable argument1 argument2) &
(cd jobdir3; myexecutable argument1 argument2) &
(cd jobdir4; myexecutable argument1 argument2) &
wait

（其中，

myexecutable argument1 argument2

只是您通常运行程序时的一个占位符；如果您使用

mpiexec

或类似的东西，则会像通常使用它一样进入其中。如果您使用OpenMP，则可以在上面第一行之前导出环境变量

OMP_NUM_THREADS

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如果你有许多任务都不会花费相同的时间，那么最容易分配的任务比（比如说）多如果系统没有gnu并行，我可以在我的主文件夹中安装它并使用它吗？我没有root权限。是的；只需下载它并运行

/configure--prefix=$home&&make&&make install

。这相当简单e安装，这非常有用，您的系统管理员应该能够在系统范围内安装它。语法可能有点复杂；这里有一个很好的教程——我如何确保这不会在同一个处理器上重叠进程？还有，多节点并行呢。例如，我的案例中的队列只允许两个节点是的，但大多数时候我只需要一个节点，如何在两个节点上并行提交两个不同的作业。我必须使用

qsub

提交，并且在提交过程中无法指定节点名称。