PubMed文章的全文PDF

在从事一个项目时，我需要下载和处理PubMed摘要的全文文章，是否有任何实现的代码或工具允许用户输入一组PubMed ID并下载免费的全文文章。非常感谢您提供的任何帮助或提示

由于PubMed的性质，我认为这在一般情况下是不可能的。您最好从PubMedCentral的开放访问子集获取文章。PubMedCentral有一个完成这项工作的工具。

实用程序StompChicken指向的是发布者在提交给PMC之前验证其XML，它们不是下载工具

请注意，PMC中的绝大多数文章都不是开放存取（OA），因此无法通过任何方式自动（合法）下载。NCBI警告：

• PMC中的大多数文章受传统版权限制，不属于该子集。有关更多信息，请阅读PMC版权声明
• PMC OAI服务和PMC FTP服务是唯一可用于从此开放访问子集自动下载文章的服务
• 禁止通过任何其他自动化过程系统检索（批量下载）文章，即使您仅从该子集检索文章
• 一些期刊使用“开放获取”标签来发表在出版时免费提供的文章，但仍受到传统版权限制。此类文章不属于此子集

要下载PMC内容，最好的方法是使用PMC Open Access FTP服务：

您还可以使用eutils查询PMC并下载OA子集的全文以及其余部分的摘要：

另一种选择是使用OAI服务：

OAI服务的文档记录非常糟糕，但以下是一些入门提示：

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如果要维护和更新PMC存储库，请尝试pubtools:

您需要使用PubMed到PMC id转换器来获取所需的PMCID，然后使用它们的电子UTIL，如Stompchick所说。PubMed中引用的许多文章都不是免费提供的。即使您的图书馆拥有正确的订阅，但大量下载也会带来挑战，因为出版商不知道您这样做时没有考虑到版权或许可证违规。我的理解是，他们将封锁港口，这可能导致整个校园关闭的尴尬后果。文本挖掘是一种合法的用途。联系你的出版商。更好的是，支持您的开放存取日志。感谢您的评论，肯定会有很大帮助：）