Perl 如何解决Circos SVG错误放置文本的问题？

为了便于说明，我将下图呈现为SVG文件，然后转换为PNG：

环绕外缘的文字标签从12点到9点方向正确，向外，远离灰色弧

在9和12之间，文本标签向内，与灰色弧重叠。这是预料不到的

下面是一个特写镜头，以澄清问题：

如果我从Circos输出PNG，而不是SVG，则标签绘制正确，但随后我将无法在Adobe Illustrator或Inkscape中标记矢量格式的SVG图形。所以我需要SVG输出

下面是与添加标签相关的

circos.conf

文件片段：

<image>
dir = /tmp
file = circos.png
png = yes
radius = 3000p
background = white
angle_offset = -176
</image>

...

<plots>
<plot>
type                           = text
color                          = black
file                           = factorList.txt
r0                             = 1r
r1                             = 1r+200p
label_size                     = 12p
label_font                     = condensedbold
padding                        = 0p
rpadding                       = 0p
label_snuggle                  = yes
max_snuggle_distance           = 1r
snuggle_sampling               = 2
snuggle_tolerance              = 0.25r
snuggle_link_overlap_test      = yes 
snuggle_link_overlap_tolerance = 2p
snuggle_refine                 = yes
</plot>
</plots>

dir=/tmp
file=circos.png
png=是
半径=3000p
背景=白色
角度_偏移=-176
...
类型=文本
颜色=黑色
file=factorList.txt
r0=1r
r1=1r+200p
标签尺寸=12p
label\u font=condensedbold
填充=0p
rpadding=0p
标签_紧贴=是
最大依偎距离=1r
依偎取样=2
紧贴公差=0.25r
依偎链接重叠测试=是
紧贴链接重叠公差=2p
依偎

---

我不确定还有什么其他选择可以尝试解决这个问题。我的问题是：我应该在这个或另一个配置文件中尝试什么，修复SVG输出？谢谢您的建议。

也许您可以尝试以下选项：

label_rotate = no

我认为上面的布局是由snuggle选项引起的，同时检查conf文件，确保plot（type=text）的所有“r0”和“r1”都大于1r

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提供足够的信息，以便在自己的系统上重现问题。指向一些输入数据并告诉您如何在命令行上调用该程序。与其“修复”循环以正确输出SVG，是否可以选择对SVG进行后处理以查找并旋转旋转不正确的项目？@daxim：感谢您提供帮助，但由于涉及到大量配置和数据文件，对于熟悉Circos的人来说，这个问题可能更容易回答。更好的解决方法是加入Circos邮件列表组。google.com/group/Circos-data-visualization。在那里，Martin和Circos用户将直接帮助您。