从php网页运行R脚本

我正在尝试构建一个php文件，允许用户运行R脚本，这样他们就不需要在服务器上打开会话，只需打开浏览器

通常脚本中的bash运行正常（说echo“something”，复制和移动数据文件，…），但R脚本没有运行。用Rscript调用R

Rscript --no-save --no-restore --verbose ./RAMS-mapa-onades-zones-manual.R > outputFile.Rout 2>&1

R输出给出了这个错误

running
  '/usr/lib/R/bin/R --slave --no-restore --no-save --no-restore'

Error in library("rgdal") : there is no package called 'rgdal'
Execution halted

嗯，库（rgdal）是R脚本的第一行。Rgdal出现在R安装中，脚本可以从命令行正常运行（Rscript myscript.R）

从php开始，运行R的用户是www数据，而终端上的用户是meteo。在我看来，需要在php Rscript执行中设置一些环境变量，但我找不到这样做的方法

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有什么想法吗？提前感谢

看来我们已经在评论中找到了根本原因。库路径不匹配，但可以通过lib.loc参数使其与库（）匹配。像这样：

library(rgdal, lib.loc = c("/home/meteo/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.1", "/usr/local/lib/R/site-library", "/usr/lib/R/library"))

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我不知道，但是。。。我要检查的第一件事是。。。但是，脚本在任何环境中运行，无论用户是谁，都可以访问相同的环境变量并知道库路径。（或者随便什么）似乎有些东西没有在这个范围内定义，也许。我会尝试在没有任何库的情况下运行一些东西。。。比如打印语句之类的。作为第一个猜测-机器上可能有多个R安装吗？检查

library（）

上的

lib.loc

参数。@LauriK

library（）

报告

/home/meteo/R/i686 pc-linux-gnu-library/3.1

，

/usr/local/lib/R/site-library

中的包，以及库（）中的警告

：库“/usr/lib/R/site library”不包含任何包

Hi@Laurik您是对的。lib.loc出现问题。添加您的建议会出现另一个问题，错误消息称，当rgdal加载需要时，sp不可用。最后，我将所有R库位置链接到

/usr/lib/R/site library

，现在R脚本运行良好。非常感谢你