Python 3.x 使用多行python输入文件中的每一行

输入

 ATTTGGC

 TGCCTTA

 CGGTATC

 GAAAATT

我希望每行输出3个mers，形成一个由所有3个mers组成的最终列表 输出应该是

[ATT, TTT, TTG, TGG, GGC, TGC, GCC...]

不是第一行的

GC\n

，也不是第二行的

TA\n

def getKmersFromDna(Dna,k):
kmer_list = []
for i in range(len(Dna)-k+1):
        kmer_list.append(Dna[i:i+k])
return list(kmer_list)

给予

---

像

['CC\n'，'C\nG'，'\nGT']

这样的输出是我不想要的。

一个非常基本的代码可以如下所示：

def getKmersFromDna(Dna,k):
    dna_list = Dna.strip().split('\n')
    kmer_list = []
    for cur_dna in dna_list: # iternating over each line of input
        for i in range(len(cur_dna)-k+1): # finding Kmer from each line of input
            kmer_list.append(cur_dna[i:i+k])
    return list(kmer_list)

印刷品：

['ATT', 'TTT', 'TTG', 'TGG', 'GGC']
['TGC', 'GCC', 'CCT', 'CTT', 'TTA']
['CGG', 'GGT', 'GTA', 'TAT', 'ATC']
['GAA', 'AAA', 'AAA', 'AAT', 'ATT']

---

你必须解释你是如何从给定的输入中得到你想要的输出的。我看到的只是一堆字符（看起来像DNA，但我不必去学习DNA来回答你的问题）。你是如何从中获得最终输出的？所以你想

.splitlines

和

.strip

去掉换行符？换行符是问题的一部分，但他的输出仍然不符合他的要求@MisterMiyagi@Error-语法自责他的（格式错误的）示例代码表明他也在学习其余的代码。唯一的问题是

Dna

是原始文件内容，而不是按行分割和剥离。@KPYTHON您如何读取文件？Python中的默认设置是逐行读取文件-您必须显式请求整个内容才能获得所显示的行为。谢谢，先生。这很有帮助。我只是在学习，这就是为什么要面对这些基本问题problems@KPYTHON如果我的回答对你有帮助，请接受并投票表决。我只是在学习。这个代码对我来说相当复杂。这将有助于我顺利完成学业。谢谢

['ATT', 'TTT', 'TTG', 'TGG', 'GGC']
['TGC', 'GCC', 'CCT', 'CTT', 'TTA']
['CGG', 'GGT', 'GTA', 'TAT', 'ATC']
['GAA', 'AAA', 'AAA', 'AAT', 'ATT']