如何最好地使用多个子包和包含bash脚本的目录来构造python项目/存储库？

下面是一个基于python的项目的目录结构。我正试图以符合PEP8的“pythonista”方式正确地构造各种包和目录。将包含bash脚本的文件夹放在根级别或项目包目录中是否正确

BreastCancer_DeepLearning
├── LICENSE
├── README.rst
├── breastcancer_ln
│   ├── __init__.py
│   ├── bash
│   ├── config
│   ├── data
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── tfrecord_read.py
│   │   ├── tfrecord_write.py
│   │   └── tfrecord_wsi_read.py
│   ├── models
│   │   ├── __init__.py
│   │   └── models.py
│   ├── predict.py
│   ├── preprocessing
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── calculate_std_mean.py
│   │   ├── calculate_weights.py
│   │   ├── patching.py
│   │   └── wsi_masks.py
│   ├── segmentation.py
│   ├── testing.py
│   ├── train.py
│   ├── tuning.py
│   └── utilities
│       ├── __init__.py
│       ├── augmentation.py
│       ├── custom_loss_classes.py
│       ├── decay_schedules.py
│       ├── evaluation.py
│       └── utils.py
├── data
├── requirements.txt
└── setup.py