矩阵对象没有属性节点networkX python

我试图将一些数字表示为带有连通分量的图的边。为此，我一直在使用python的networkX模块。
我的图是G，其节点和边初始化如下：

    G = nx.Graph()
    for (x,y) in my_set:
       G.add_edge(x,y)

    print G.nodes() #This prints all the nodes
    print G.edges() #Prints all the edges as tuples
    adj_matrix = nx.to_numpy_matrix(G)

一旦我添加了以下行

    pos = nx.spring_layout(adj_matrix)

我得到了上面提到的错误。 如果可能有用，则所有节点都以9-15位数字进行编号。有412个节点和422条边

详细错误：

      File "pyjson.py", line 89, in <module>
      mainevent()        
      File "pyjson.py", line 60, in mainevent
      pos = nx.spring_layout(adj_matrix)
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/networkx/drawing/layout.py", line 244, in fruchterman_reingold_layout
      A=nx.to_numpy_matrix(G,weight=weight)
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/networkx/convert_matrix.py", line 128, in to_numpy_matrix
      nodelist = G.nodes()
      AttributeError: 'matrix' object has no attribute 'nodes'

文件“pyjson.py”，第89行，在
mainevent（）
mainevent中第60行的文件“pyjson.py”
位置=nx.弹簧布局（调整矩阵）
fruchterman\u reingold\u布局中的文件“/usr/local/lib/python2.7/dist packages/networkx/drawing/layout.py”，第244行
A=nx.到numpy矩阵（G，权重=权重）
文件“/usr/local/lib/python2.7/dist packages/networkx/convert_matrix.py”，第128行，在to_numpy_矩阵中
nodelist=G.nodes（）
AttributeError:“矩阵”对象没有属性“节点”

编辑：在下面解决。有用信息：pos为每个节点创建带有坐标的dict。执行nx.draw（G，pos）会创建一个pylab图形。但它不会显示它，因为pylab不会自动显示。

将网络图作为第一个参数，而不是numpy数组。根据Fruchterman-Reingold力定向算法，它返回的是节点的位置

import networkx as nx
import pylab as py

G = nx.Graph()
for (x,y) in my_set:
   G.add_edge(x,y)

print G.nodes() #This prints all the nodes
print G.edges() #Prints all the edges as tuples
pos = nx.spring_layout(G)
nx.draw(G,pos)
py.show() # or py.savefig('graph.pdf') if you want to create a pdf, 
          # similarly for png or other file types

因此，您需要将其传递给

draw

示例：

import networkx as nx
%matplotlib inline
G=nx.lollipop_graph(14, 3)
nx.draw(G,nx.spring_layout(G))

收益率：

（此答案中的一些内容涉及到您评论中的一些内容。您能否将这些内容添加到您的问题中，以便以后的用户获得更多的上下文信息）

pos

为每个节点创建带有坐标的dict。执行

nx.draw（G，pos）

会创建一个pylab图形。但它不会显示它，因为pylab不会自动显示

import networkx as nx
import pylab as py

G = nx.Graph()
for (x,y) in my_set:
   G.add_edge(x,y)

print G.nodes() #This prints all the nodes
print G.edges() #Prints all the edges as tuples
pos = nx.spring_layout(G)
nx.draw(G,pos)
py.show() # or py.savefig('graph.pdf') if you want to create a pdf, 
          # similarly for png or other file types

---

最后的

py.show（）

将显示它

py.savefig（'filename.extension'）

将根据您用于

扩展的内容另存为多种文件类型中的任意一种

不清楚您在这里尝试的是将图形作为第一个参数，而不是矩阵array@EdChum：我不知道，谢谢。我如何才能真正让绘图显示出来？nx.draw（G）不会抛出任何错误，但它也不会出现。

sprint_布局

返回节点位置，您需要将其传递给

nx.draw

以便

nx.draw（G，nx.spring_布局（G））

可以工作，我可以发布一个示例如果我的答案解决了您的问题，请接受答案，在我的答案的左上角会有一个空的勾号，你也可以试试这个，我需要包括nx.lollipop_图部分吗？虽然没有抛出错误，但我的程序实际上并没有显示带有此选项的图形。编辑：我添加了一个show后得到了。棒棒糖图只是一个图形生成器，我不知道你想构建什么图形，但我想这会演示它是如何工作的，以及它是如何显示的。如果我的答案完全解决了你的问题，那么请接受它，答案左上角将有一个空的勾号，谢谢