Python sqlalchemy：没有主键和重复值的表？

我正在使用由第三方使用sqlalchemy创建的现有数据库。但是，我遇到了一些问题，因为表没有主键，更糟糕的是，它们的每一行都有重复的元素，所以我不能选择一个现有列作为主键。这些表有两列：都有非唯一值

我试着按照猴子修补桌子，但显然这不起作用（见下文）

我当前的代码是（

MirnaTable

是我的映射类，基本上只是一个框架，没有其他东西）

然后我试着举个例子

all_records = session.query(MirnaTable).all()

我得到

sqlalchemy.exc.OperationalError: (OperationalError) no such column: miranda.id 
u'SELECT miranda.gene_id AS miranda_gene_id, miranda."mature_miRNA" AS
"miranda_mature_miRNA", miranda.id AS miranda_id \nFROM miranda' ()

因此，当然找不到id列。你知道我做错了什么吗？提前谢谢

编辑：根据要求，下面是表中的一个示例（直接从sqlite检索）：

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首先确保id列存在，然后您尝试了大写和小写

还可以为表设置两个主键：

Column("id", Integer, primary_key=True),
Column("secondColumn", Integer, primary_key=True)

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但是，如果任何其他行与该行完全匹配，则这可能会导致更新异常。你最好重新创建表格，插入你自己的PK列，因为你误解了你提到的帖子。必须选择现有列并将其定义为主列。也可以通过将它们全部放在定义中来设置复合主键。在你的例子中，我认为一个基因有几个成熟的microRNA，所以主键应该由

（基因id，成熟的miRNA）

对组成。由于表中没有更多字段，因此不需要使用

autoload=True

标志

db_table = Table("miranda", metadata,
                 Column("gene_id", Integer, primary_key=True),
                 Column("mature_miRNA", Integer, primary_key=True))

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我不知道表中的字段类型，因此如果它们不是整数，请适当更改它们。

将sqlite数据库的列id更改为rowid

原件：

修改：

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我可以这样做，但我会尽量避免这种情况，因为它来自第三方，这将意味着这样一个数据库的分叉与所有的问题，esue。另外，两个列（我尝试使用monkey patch的列除外）都有重复的值（是的，非常混乱，但我没有这么做…）。编辑：忘了说，“id”列不存在。我按照问题中链接的示例对表进行了monkey patch（但它不起作用）。您能用示例数据发布表吗？完成：有一个示例，说明您现在可以期望什么样的数据。如果没有可以用作行标识的内容，ORM将无法工作。考虑直接使用表，而不将它映射到类。我相应地设置了类型，现在得到了正确的结果（与使用sqlite3的标准查询相比）。根据您在问题中更新的数据，这些对也不是唯一的，因此它们不能用作主键。ORM的某些部分，如简单查询，可以工作，而另一些部分则可能被禁用的重新加载欺骗。但不要期望一切都能成功。我主要使用equality和IN（这是一个非常简单的用例），但我会做一些精确的测试以防万一。

Column("id", Integer, primary_key=True),
Column("secondColumn", Integer, primary_key=True)

db_table = Table("miranda", metadata,
                 Column("gene_id", Integer, primary_key=True),
                 Column("mature_miRNA", Integer, primary_key=True))

db_table = Table("miranda", metadata,
                 Column("id", Integer, primary_key=True),
                 autoload=True)

db_table = Table("miranda", metadata,
                 Column("rowid", Integer, primary_key=True),
                 autoload=True)