如何将返回值（来自上一个函数）读入pandas、python中？

在下面的节目中

我想从下游函数中的一个函数访问/通过管道传输数据

python代码如下所示：

def main():
data1, data2, data3 = read_file()
do_calc(data1, data2, data3)   

def read_file():
    data1 = ""
    data2 = ""
    data3 = ""

    file1 = open('file1.txt', 'r+').read()
    for line in file1
        do something....
        data1 += calculated_values

    file2 = open('file2.txt', 'r+').read()
    for line in file1
        do something...
        data2 += calculated_values    

    file1 = open('file1.txt', 'r+').read()
    for line in file1
        do something...
        data3 += calculated_values

    return data1, data2, data3

def do_calc(data1, data2, data3):
    d1_frame = pd.read_table(data1, sep='\t')
    d2_frame = pd.read_table(data2, sep='\t')
    d3_frame = pd.read_table(data3, sep='\t')

    all_data = [d1_frame, d2_frame, d3_frame]

main()

给定的代码有什么问题？看起来panda无法正确读取输入文件，但正在将数据1、2和3中的值打印到屏幕上

read_hdf似乎可以读取文件，但无法正确读取。是否有一种方法可以将函数返回的数据直接读取到pandas中（无需写入/读取文件）

错误消息：

Traceback (most recent call last):

  File "calc.py", line 757, in <module>

    main()

  File "calc.py", line 137, in main

    merge_tables(pop1_freq_table, pop2_freq_table, f1_freq_table)

  File "calc.py", line 373, in merge_tables

    df1 = pd.read_table(pop1_freq_table, sep='\t')

  File "/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 645, in parser_f

    return _read(filepath_or_buffer, kwds)

  File "/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 388, in _read

    parser = TextFileReader(filepath_or_buffer, **kwds)

  File "/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 729, in __init__

    self._make_engine(self.engine)

  File "/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 922, in _make_engine

    self._engine = CParserWrapper(self.f, **self.options)

  File "/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site-packages/pandas/io/parsers.py", line 1389, in __init__

    self._reader = _parser.TextReader(src, **kwds)

  File "pandas/parser.pyx", line 373, in pandas.parser.TextReader.__cinit__ (pandas/parser.c:4019)

  File "pandas/parser.pyx", line 665, in pandas.parser.TextReader._setup_parser_source (pandas/parser.c:7967)

FileNotFoundError: File b'0.667,0.333\n2\t15800126\tT\tT,A\t0.667,0.333\n2\t15800193\tC\tC,T\t0.667,0.333\n2\t15800244\tT\tT,C\......

回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“calc.py”，第757行，在
main（）
文件“calc.py”，第137行，主
合并表格（pop1表格、pop2表格、f1表格）
文件“calc.py”，第373行，在合并表格中
df1=pd.read\u表（pop1\u freq\u表，sep='\t'）
文件“/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site packages/pandas/io/parsers.py”，第645行，在解析器中
返回读取（文件路径或缓冲区，kwds）
文件“/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site packages/pandas/io/parsers.py”，第388行，已读
parser=TextFileReader（文件路径或缓冲区，**kwds）
文件“/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site packages/pandas/io/parsers.py”，第729行，在__
自制发动机（自制发动机）
文件“/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site-packages/pandas/io/parsers.py”，第922行，在引擎中
self.\u engine=CParserWrapper（self.f，**self.options）
文件“/home/everestial007/.local/lib/python3.5/site packages/pandas/io/parsers.py”，第1389行，在__
self.\u reader=\u parser.textleader（src，**kwds）
文件“pandas/parser.pyx”，第373行，位于pandas.parser.TextReader.\u u cinit__;（pandas/parser.c:4019）中
文件“pandas/parser.pyx”，第665行，位于pandas.parser.TextReader.\u设置\u解析器\u源（pandas/parser.c:7967）
FileNotFoundError:文件b'0.667,0.333\n2\t15800126\tT\tT，A\t0.667,0.333\n2\t15800193\tC\tC，T\t0.667,0.333\n2\t15800244\tT\tT，C\。。。。。。

希望您能给我解释。

pd.read\u table（data1，sep='\t'）

将

data1

视为一个文件路径，因为它没有

read

方法。您可以在stacktrace中看到，它试图打开一个名为csv文件内容的文件

从

read_表

帮助：

您应该将其转换为

io.StringIO

对象，以便读取

快速修复：

pd.read_table(io.StringIO(data1), sep='\t')

但这会创建数据的副本。最好的解决方法是直接创建

io.StringIO

缓冲区：

def read_file():
    data1 = io.StringIO()


    file1 = open('file1.txt', 'r+').read()
    for line in file1
        do something....
        data1.write(calculated_values)

    # in the end
    data1.seek(0)  # reset to start of "file"

pd.read\u表（data1，sep='\t'）

将

data1

视为文件路径，因为它没有

read

方法。您可以在stacktrace中看到，它试图打开一个名为csv文件内容的文件

从

read_表

帮助：

您应该将其转换为

io.StringIO

对象，以便读取

快速修复：

pd.read_table(io.StringIO(data1), sep='\t')

但这会创建数据的副本。最好的解决方法是直接创建

io.StringIO

缓冲区：

def read_file():
    data1 = io.StringIO()


    file1 = open('file1.txt', 'r+').read()
    for line in file1
        do something....
        data1.write(calculated_values)

    # in the end
    data1.seek(0)  # reset to start of "file"

（1） 我建议您使用

pd.read\u csv（file1，sep=“\t”）

而不是read table。（2） 如果每个文件都包含一列，为什么不将它们直接读入熊猫并进行计算？这将使您的生活比编写单独的函数来读取容易得多。（1）我建议您使用

pd.read\u csv（file1，sep=“\t”）

而不是read table。（2） 如果每个文件都包含一列，为什么不将它们直接读入熊猫并进行计算？这将使你的生活比编写一个单独的函数来阅读容易得多。