Python和16位Tiff

如何在Python中转换和保存16位单通道TIF

我可以毫无问题地加载16位和32位图像，并且可以看到32位图像是mode

F

，16位图像是mode

I；16S

：

import Image
i32 = Image.open('32.tif')
i16 = Image.open('16.tif')
i32
# <TiffImagePlugin.TiffImageFile image mode=F size=2000x1600 at 0x1098E5518>
i16
# <TiffImagePlugin.TiffImageFile image mode=I;16S size=2000x1600 at 0x1098B6DD0>

如果我转换32位图像，我可以保存它：

i32.convert('L').save('foo.png')

但同样的命令不适用于16位图像：

i16.convert('L').save('foo.png')
# ValueError: unrecognized mode

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您似乎遇到了一个PIL错误，或者是一个尚未实现的角落案例

这里有一个解决方法：

i16.mode = 'I'
i16.point(lambda i:i*(1./256)).convert('L').save('foo.png')

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对于从16位灰度TIFF到PNG的无损转换，请使用：

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无意中发现此线程试图使用PIL/numpy保存16位TIFF图像

版本：python 2.7.1-numpy 1.6.1-PIL 1.1.7

这是我写的一个快速测试。uint16 numpy数组->转换为字符串->转换为“I”类型的PIL图像；16'->另存为16位TIFF

在ImageJ中打开图像显示右侧水平渐变图案，图像类型为“每像素位：16（无符号）”

编辑：从1.1.7开始，PIL不支持编写压缩文件，但支持（lzw压缩）。因此，测试代码变为（使用pylibtiff 0.3测试）：

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请注意：测试代码已更改以生成垂直梯度，否则，无法实现压缩（请参阅警告：pylibtiff当前支持读取和写入使用TIFF条存储的图像）。

使用PIL 4.1将ImageJ TIFF转换为JPEG+

im = numpy.array(Image.open('my.tiff'))
image = Image.fromarray(im / numpy.amax(im) * 255)
image.save('my.jpg')

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Pil应该有支持：“（1.1.4a2发布）改进了对16位无符号整数图像的支持（模式“I；16”）。这包括TIFF读取器支持，以及对“getextrema”和“point”的支持（来自Klamer Shutte）。“您能提供一个示例文件吗？好的。我正在使用PIL1.1.7，所以支持就在那里。编辑了这个问题。问题不是PIL，但我仍然不知道我做错了什么…我仍然希望看到一个示例文件。这是一个示例文件：和32位：我得到：

ValueError:unknown raw mode

@mankoff:对不起，我一定是用了两种不同的方法尝试了它并复制了错误的一种。我编辑了

mode='I；16'

到

mode='I'

，现在试试。这似乎有效。数据丢失了吗？我认为（？）I模式是8位的。@mankoff，如果没有其他东西，到L模式的转换将被截断为8位。如果要查看原始数据，请在模式设置为

'I'

后尝试

getpixel

或

load

。这怎么可能是无损的？从每像素16位变为8位。PNG格式支持每通道16位灰度（1通道）。我已经使用PNG很多年了，从来都不知道它支持每通道16位。回到RFC2083，我可以看到从一开始就是这样。谢谢你今天教我一些东西！很好的解决方案，但是PythonMagick没有包含在许多默认安装（EPD、sage）中，这使得代码的可移植性降低。

from PythonMagick import Image
Image('pinei_2002300_1525_modis_ch02.tif').write("foo.png")

import Image
import numpy

data = numpy.zeros((1024,1024),numpy.uint16)

h,w = data.shape

for i in range(h):
    data[i,:] = numpy.arange(w)

im = Image.fromstring('I;16',(w,h),data.tostring())
im.save('test_16bit.tif')

import Image
import numpy
from libtiff import TIFFimage

data = numpy.zeros((1024,1024),numpy.uint16)

h,w = data.shape

for i in range(w):
    data[:,i] = numpy.arange(h)

tiff = TIFFimage(data, description='')
tiff.write_file('test_16bit.tif', compression='lzw')
#flush the file to disk:
del tiff

im = numpy.array(Image.open('my.tiff'))
image = Image.fromarray(im / numpy.amax(im) * 255)
image.save('my.jpg')