Python 在windows上使用带有cygwin的anaconda环境

试图通过Windows NT上的cygwin界面使用anaconda设置环境，但失败

创建环境（

conda create-n test_env

）工作正常。但是

激活测试环境

失败

我试着用：

export PATH=/cygdrive/c/users/nick/anaconda3/envs/test:$PATH

---

这修复了一些行为（

哪个python

指向正确的python）。但是如果我随后执行“conda install”命令，它将安装到根anaconda目录中，而不是安装到环境中。也许导出是bash会话的本地，conda调用了不同版本的PATH？有没有办法使PATH的修改成为全局的？

由于Cygwin模拟linux环境，我们需要使用“源代码激活测试环境”而不是“激活测试环境”。

经过一段时间的努力，我认为我已经找到了一种合理可行的方法来集成Anaconda的python（以及相关环境）塞格温。假设Cygwin和Anaconda都独立工作，要从Cygwin访问所有Anaconda工具，下面在

.bash\u profile

中的设置似乎可以做到这一点。（我只包括了与集成相关的

.bash_profile

部分……希望我没有无意中遗漏一些内容。）

这个设置基本上做了三件事。首先，用户需要明确地将目录

$CONDA_BASE_DIR

设置为安装CONDA/anaconda/miniconda基本环境的位置。其次，

.bash\u profile

中有一个功能，可以使用shell变量

$conda\u DEFAULT\u ENV

跟踪当前的conda环境。最后，我们定义了一个别名

cyg-conda

和一个函数

cyg-activate

，用作标准

conda

和

activate

命令的替换命令。请注意，变量名

$CONDA_DEFAULT_ENV

是特殊的，由实际的

CONDA

命令在内部使用

使用此设置，我可以使用

cyg-conda

和

cyg-activate

，就像我通常在Anaconda命令提示符下使用

conda

和

activate

一样，同时使我的Cygwin bash shell可以使用环境

当然可以接受改进建议等

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#  Anaconda Environment Selection - Plese set CONDA_BASE_DIR to the directory
#  containing the base installation of anaconda/miniconda.

export CONDA_BASE_DIR=/cygdrive/c/Users/Patrick/Miniconda3

#  Proxy Servers & Network Setup (if needed)

export HTTP_PROXY=
export HTTPS_PROXY=

#  IMPORTANT - Ignore carriage returns when using a Cygwin environment.

export SHELLOPTS
set -o igncr

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#  Manage conda environments for Python.  We check the environment variable
#  $CONDA_DEFAULT_ENV to see which environment is desired.  The default (root)
#  environment will be chosen if nothing is specified.  Note that this variable
#  will be explicitly managed by the cyg-activate ( ) function we have defined
#  below, specifically for the purpose of changing environments.  The root
#  environment is also handled slightly different from the others when it comes
#  to setting the CONDA_DEFAULT_ENV variable.

if [ ${CONDA_DEFAULT_ENV} ] && [ ${CONDA_DEFAULT_ENV} != 'root' ] 
then
    #  SELECT ONE OF THE NON-DEFAULT ENVIRONMENTS
    export CONDA_PREFIX=${CONDA_BASE_DIR}/envs/${CONDA_DEFAULT_ENV}
else
    #  SELECT THE DEFAULT ENVIRONMENT (and set CONDA_DEFAULT_ENV full path)
    export CONDA_DEFAULT_ENV=root
    export CONDA_PREFIX=${CONDA_BASE_DIR}
fi

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#  Define cyg-conda and cyg-activate to facilitate management of conda.

alias cyg-conda=${CONDA_BASE_DIR}/Scripts/conda.exe

cyg-activate() {
    export CONDA_DEFAULT_ENV=$1
    source ~/.bash_profile
    cyg-conda info --envs
}

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#  PATH - ALl of the anaconda/miniconda path entries appear first.

PATH=
PATH=$PATH:$CONDA_PREFIX
PATH=$PATH:$CONDA_PREFIX/Library/mingw-w64/bin
PATH=$PATH:$CONDA_PREFIX/Library/usr/bin
PATH=$PATH:$CONDA_PREFIX/Library/bin
PATH=$PATH:$CONDA_PREFIX/Scripts
PATH=$PATH:$HOME/scripts
PATH=$PATH:$HOME/local/bin
PATH=$PATH:/usr/local/bin
PATH=$PATH:/usr/bin

export PATH

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截至目前，cygwin支持以下语法的激活和停用命令（链接文档还提供了将conda添加到

路径

的最佳实践，值得查看）：

conda激活
康达酒店

然而，有一个因素阻止了这些操作的开箱即cygwin使用的bash脚本都有Windows行结尾（CRLF）。要解决此问题，有两个选项：

将以下内容添加到您的

.bash\u配置文件

或

.bashrc

（如@patrickkelly答案中的脚本所示）：

if[[“${OSTYPE}”=='cygwin']]；然后
设置-o点火开关
出口贝壳
fi

使用类似的工具将相关文件的行尾更改为Unix样式（LF）。必须转换位于conda安装目录中的以下文件，可能还有其他文件：

• etc/profile.d/conda.sh

• 脚本/激活

• 脚本/停用

更新：当康达更新自身时，上述文件至少在某些时候被覆盖，恢复CRLF行结尾，因此在这些情况下必须重复将其转换为LF的过程

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使用激活的环境conda和cygwin的一种方法是：

• 打开cmd:Win+R并写入cmd
• 激活康达：康达激活环境
• 打开cygwin:cygwin（对于此cygwin，必须将其添加到路径）

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不幸的是，它抛出了自己的错误。在anaconda论坛上，答案似乎是“等待4.1或使用开发版本”--它在那里被修复了具体地说，我得到了

bash:/usr/bin/conda:没有设置这样的文件或目录

——如果我正在运行ZSH，则需要输入igncr？要使此集成工作，需要记住一些事情。（i） 请直接从安装程序安装Anaconda，而不是像Chocolate这样从软件包管理器安装Anaconda，因为这种方法必须在Anaconda根目录下才能工作。（ii）为了让anaconda python在cygwin命令行中工作，必须使用

python-i

。只需使用

python

即可冻结屏幕。为了让事情更清楚，您需要

source

此脚本（手动或在.bashrc中），然后运行

cyg activate

然后

source activate

您的环境项1。这个答案解决了我所有的Anaconda/Cygwin问题。似乎有许多以dos行结尾的脚本。即使在我执行“conda init bash”时，我的.bash_配置文件也会在添加“eval”命令后自动转换为dos，从而中断bash启动。请参见最近的miniconda（4.7.10）对我有效。以前我有过不少Cygwin的烦恼，但值得注意的是，仅仅设置

igncr

似乎就解决了所有问题。我认为自上次尝试以来，其他一些小错误已经修复。当使用建议#1时，

conda activate

不会激活环境，但

source activate

会激活