如何将整数值传递给python的subprocess.call方法？

我试图将整数值传递到python的subprocess.call方法中：

subprocess.call('samtools','view','-bq', '1','DS130.bam','>','DS130umr.bam')

'-bq'后面的参数必须是整数值。但是，我相信subprocess.call会一直将其视为字符串，因此我不断收到错误“TypeError:bufsize必须是整数”

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如何获取subprocess.call以将“1”解释为整数值？

这与输入中的整数无关；您错误地调用了该函数。您需要将命令作为一个序列传入，一个列表：

但是，这不会由shell处理，因此输出重定向>将不起作用。如果要将工具的输出定向到另一个文件，请使用shell=True并传入字符串：

subprocess.call('samtools view -bq 1 DS130.bam > DS130umr.bam', shell=True)

对于要处理的shell，或使用输出重定向：

with open('DS130umr.bam', 'wb') as redirected:
    subprocess.call(['samtools','view','-bq', '1','DS130.bam'], stdout=redirected)

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这与输入中的整数无关；您错误地调用了该函数。您需要将命令作为一个序列传入，一个列表：

但是，这不会由shell处理，因此输出重定向>将不起作用。如果要将工具的输出定向到另一个文件，请使用shell=True并传入字符串：

subprocess.call('samtools view -bq 1 DS130.bam > DS130umr.bam', shell=True)

对于要处理的shell，或使用输出重定向：

with open('DS130umr.bam', 'wb') as redirected:
    subprocess.call(['samtools','view','-bq', '1','DS130.bam'], stdout=redirected)

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我能够正确地使用参数shell=True执行subprocess.call。然而，当我尝试使用输出重定向时，我得到了这个错误，ValueError:stdout参数not allowed，它将被覆盖。结果我改为这样做了，它成功了：使用打开的'DS130umr.bam'，'wb'作为sys.stdout:subprocess.check_output['samtools'，'view'，'-bq'，'1'，'DS130.bam']@JayKu12：对不起，我想用subprocess.call代替；您需要小心分配给sys.stdout；现在，您需要使用sys.stdout=sys来恢复原始值。\uuu stdout\uuu。我能够正确地使用参数shell=True执行subprocess.call。然而，当我尝试使用输出重定向时，我得到了这个错误，ValueError:stdout参数not allowed，它将被覆盖。结果我改为这样做了，它成功了：使用打开的'DS130umr.bam'，'wb'作为sys.stdout:subprocess.check_output['samtools'，'view'，'-bq'，'1'，'DS130.bam']@JayKu12：对不起，我想用subprocess.call代替；您需要小心分配给sys.stdout；您现在需要使用sys.stdout=sys.\uuu stdout\uuu恢复原始文件。