如何在MonetDB中调试SQL/Python UDF

在Monetdb的SQL UDF中使用本机Python代码非常强大。但是，调试这样的UDF可以从更多的支持中获益。特别是，如果我使用老式的打印（“调试信息”），它会消失在巨大的黑色空白中

create function dummy() 
returns string
language python{
    print('Entering the dummy UDF')
    return 'hello';
};

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如何从服务器或MonetDB客户端检索此信息。

上周我调试了一些Python UDF:）

步骤1：首先确保您的Python代码至少在Python解释器中工作

步骤2：在Python UDF中，编写调试信息。到文件，例如：

    f = open('/tmp/debug.out', 'w')
    f.write('my debugging info\n')
    f.close()

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这并不理想，但很有效。此外，我还使用它导出Python UDF的参数值。通过这种方式，我可以在Python解释器中使用从MonetDB收到的确切数据运行Python UDF的主体。

以防有人对这个问题感兴趣。 调试MonetDB的Python/UDF有两种新方法

1） 使用python客户端pymonetdb（）。 你可以安装它抛出pip

pip install numpy

要使用它，请考虑以下设置，其中包含一个整数的表和一个计算给定列的平均绝对偏差的UDF

CREATE TABLE integers(i INTEGER);
INSERT INTO integers VALUES (1), (3), (6), (8), (10);

CREATE OR REPLACE FUNCTION mean_deviation(column INTEGER)
RETURNS DOUBLE LANGUAGE PYTHON {
  mean = 0.0
  for i in range (0, len(column)):
    mean += column[I]
  mean = mean / len(column)
  distance = 0.0
  for i in range (0, len(column)):
    distance += column[i] - mean
  deviation = distance/len(column)
  return deviation;
};

要使用终端调试（即pdb）调试函数，只需使用pymonetdb.connect（）打开数据库连接，然后从连接中获取游标对象，并通过游标对象调用debug（）函数，将要检查的SQL和要调试的UDF名称作为参数发送

import pymonetdb
conn = pymonetdb.connect(database='demo') #Open Database connection
c = conn.cursor()
sql = 'select mean_deviation(i) from integers;'
c.debug(sql, 'mean_deviation') #Console Debugging

有一个可选的采样步骤，只传输数据的统一随机样本，而不是完整的输入数据集。如果希望采样，只需发送希望从采样中获得的元素数量（例如，如果希望得到10个元素的子集，则发送c.debug（sql，'mean_deviation'，10））

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2） 使用PyCharm的名为devudf的POC插件，您可以安装该插件并打开PyCharm的插件页面，或者直接转到JetBrains页面：。它在主菜单中添加了一个名为“UDF开发”的选项，允许您直接将UDF从数据库导入和导出到pycharm，并享受IDE的调试功能。

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