Python键错误：'\n'；

我使用下面的脚本从fastq文件中提取分子条形码。但是，我一直得到以下关键错误

File "extractMolecularBarcode.py", line 42, in <module>
    dicoBarcode[barcode] += 1
KeyError: '\n'

---

文件中有一个换行符，当您使用

 dicoBarcode[barcode] += 1

条形码值是一个换行符或“\n”，它会导致错误

您可以通过提供默认值来克服它：

discoBarcode.get(barcode,YOURDEFAULT)

或者您可以先删除换行符，然后处理文件；）

---

问题在于，您没有在

条码

值的实际行上调用

rstrip（）

。您需要编辑以下行：

totseq= iFastq.readline()
plus = iFastq.readline()
qual = iFastq.readline()

所以它们看起来像这样：

totseq= iFastq.readline().rstrip()
plus = iFastq.readline().rstrip()
qual = iFastq.readline().rstrip()

---

谢谢你的回答。你有什么建议来消除这个问题吗？我不理解使用双叶编码.get（条形码，你的默认值）的那个。你能再解释一下吗？非常感谢。谢谢你的回答。当我在其他问题中寻找关于键错误的答案时，我尝试了rstrip，但它仍然给了我相同的错误：/

KeyError

只是意味着特定键

\n

不在词典中，因此读取/增量失败。我尝试解决原始问题。我已再次尝试在两个rstrip中添加\n（在“while”开始之前的一个和在“while”循环结束时的一个）。它不起作用。这又给了我同样的错误。在上一步中，我完成了适配器的拆卸。可能是这一步中的问题导致了这个错误？@mordel很抱歉，我在两个方面弄错了。编辑了答案。1.

rstrip（）

会删除

\n

和2。您可以从另一个

readline（）

中获取条形码值，该行没有

rstrip

我按照您的建议将rstrip添加到这三行的末尾（totseq、plus和qual）。仍然没有改变：(

totseq= iFastq.readline()
plus = iFastq.readline()
qual = iFastq.readline()

totseq= iFastq.readline().rstrip()
plus = iFastq.readline().rstrip()
qual = iFastq.readline().rstrip()