Python 按表外合并子目录中的文件

我有一个文件夹（split_libs），其中的子文件夹根据SraRunTable3.txt第9列和第32列中描述的示例_名称命名，每个子文件夹都与sra_研究相关。在每个子文件夹中都有一个seqs.fna文件，很遗憾，我无法更改该文件的名称-它是QIIME命令的输出

我想通过读取子文件夹名称（=示例名称），根据sra_研究将seqs.fna文件合并到子文件夹中。e、 g.来自同一SRA研究的所有seqs.fna将合并

目录的示例概述：

split_libs
    sample1
      seqs.fna
    sample2
      seqs.fna
    sample3
      seqs.fna

SraRunTable的示例概述：

(...)Sample_Name(...)SRA_Study(...)
     sample_1        study_1
     sample_2        study_1 
     sample_3        study_2

以下是我迄今为止所尝试的：

import os
from operator import itemgetter

fields = itemgetter(9, 32)

with open('/home/andre/Desktop/PRJEB0000/SraRunTable3.txt') as csvfile:
next(csvfile)
for line in csvfile:
    sample_name, sra_study = fields(line.split())
for folder in os.listdir('./split_libs'):
    if folder == sample_name:
        open('seqs.fna') as infile, open('/home/andre/Desktop/PRJEB0000/cat_fna/' + sra_study + ".fna", 'a') as outfile:
            outfile.write(infile.read())

这个问题源于

任何贡献将不胜感激

import os
from operator import itemgetter

fields = itemgetter(9, 32)

with open('/home/andre/Desktop/PRJEB0000/SraRunTable3.txt') as csvfile:
next(csvfile)
for line in csvfile:
    sample_name, sra_study = fields(line.split())
    #open the folder corresponding to sample_name and add the seqs to the appropriate study file
    with open('split_libs/'+sample_name+'/seqs.fna') as infile, open('/home/andre/Desktop/PRJEB0000/cat_fna/' + sra_study + ".fna", 'a') as outfile:
            outfile.write(infile.read())

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@mhawke，就像我们说的，这是改进后的回复！