Python h5py：如何重命名尺寸？

我创建了一个句柄为fw的新文件

fw.create_dataset('grp1/varname',data=arr)

这些组是在此命令之前创建的。arr是一个维数为（2,3）的numpy数组。文件已成功创建。但是，尺寸标注分别命名为“假_0”和“假_1”。我怎么把它们改成m和n

一般来说，如何在组内创建维度，然后将变量与之关联

我试过了

fw['grp1/varname'].dims[0].label = 'm'

但这并没有达到预期的效果

创建的文件上的

ncdump-h

显示：

group: grp1 {

        dimensions:
                phony_dim_0 = 2 ;
                phony_dim_1 = 3 ;

        variables:

                float varname(phony_dim_0, phony_dim_1) ;
                        string varname:DIMENSION_LABELS = "m", NIL, NIL ;
        } // group grp1

谢谢

打印（[fw['grp1/varname'].dims中dim的dim.label]） 不会产生一致的输出。 [u'm'，u']

hdffile似乎没有将维度与组关联的规定。然而，varname是一个变量。如何获得：

   variables:
            float varname(m, phony_dim_1) ;
                    string varname:DIMENSION_LABELS = "m", NIL ;
    } // group grp1

在ncdump-h或h5dump的输出中？我确实尝试了不同的h5dump选项

---

谢谢。

您的输出表明

varname

数据集的第一个维度标签是“m”。那些虚假的尺寸标签只保留每个尺寸的实际尺寸，而不是标签

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打印的输出是什么（[dim.label for dim in fw['grp1/varname'].dims]）

？

部分问题可能是您使用了

ncdump

我可以制作一个简单的文件，并为数据集设置

dims

标签：

In [420]: import h5py
In [421]: f = h5py.File('testdim.h5','w')
In [422]: ds = f.create_dataset('grp1/varname', data = np.arange(10))
In [423]: ds
Out[423]: <HDF5 dataset "varname": shape (10,), type "<i8">

该组没有

dims

：

In [442]: g = f['grp1']
In [443]: g
Out[443]: <HDF5 group "/grp1" (1 members)>
In [444]: g.dims
AttributeError: 'Group' object has no attribute 'dims'

In [446]: f.flush()

使用设计用于显示

netcdf

文件的

ncdump

：

1902:~/mypy$ ncdump -h testdim.h5 
netcdf testdim {

group: grp1 {
  dimensions:
    phony_dim_0 = 10 ;
  variables:
    int64 varname(phony_dim_0) ;
        string varname:DIMENSION_LABELS = "m" ;
  } // group grp1
}

尽我所能，

h5df

格式没有组维度

ncdump

为其创建一个虚拟属性

为了重申对上一个问题的回答，HDF5维度的文档如下：

对于HDF5文件

如果未使用尺寸比例，则netCDF-4仍可以编辑该文件，并将为每个变量形状创建匿名尺寸

NETCDF具有共享维度，HDF5具有维度比例。他们不太一样

在HDF5数据模型中，没有共享维度的概念（与netCDF不同）。HDF5数据集的形状指定为维度长度列表。但是，netCDF-4库使用HDF5作为其存储后端。它使用HDF5标注比例表示共享标注

昨天的问题:

1902:~/mypy$ h5dump testdim.h5 
HDF5 "testdim.h5" {
GROUP "/" {
   GROUP "grp1" {
      DATASET "varname" {
         DATATYPE  H5T_STD_I64LE
         DATASPACE  SIMPLE { ( 10 ) / ( 10 ) }
         DATA {
         (0): 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9
         }
         ATTRIBUTE "DIMENSION_LABELS" {
            DATATYPE  H5T_STRING {
               STRSIZE H5T_VARIABLE;
               STRPAD H5T_STR_NULLTERM;
               CSET H5T_CSET_ASCII;
               CTYPE H5T_C_S1;
            }
            DATASPACE  SIMPLE { ( 1 ) / ( 1 ) }
            DATA {
            (0): "m"
            }
         }
      }
   }
}
}

1902:~/mypy$ ncdump -h testdim.h5 
netcdf testdim {

group: grp1 {
  dimensions:
    phony_dim_0 = 10 ;
  variables:
    int64 varname(phony_dim_0) ;
        string varname:DIMENSION_LABELS = "m" ;
  } // group grp1
}