Python 对每组文件重复该命令

我正在一个叫做ObiTools的程序中处理DNA序列数据。我想找到一种方法，为同一文件夹中的每一组文件重复一个命令

例如，如果我有这些文件

Sequence_A1_R1.fastq,
Sequence_A1_R2.fastq,
Sequence_A2_R1.fastq,
Sequence_A2_R2.fastq,
etc.

我希望为X的每个值运行以下命令，以便X始终是相同的值（没有不同值的组合）

IlluminaPaireEnd Sequence\u X_R1.fastq Sequence\u X_R2.fastq>Sequence\u X_PaireEnd.fastq

有没有一个python脚本可以很容易地做到这一点

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谢谢

假设您的文件在文件列表中并且已经包含在早期的Python代码中，您可以执行以下操作：

对于范围内的文件位置（0，len（文件列表），2）： command=“IlluminaPaireEnd”+ 文件列表[文件位置]+ 文件列表[文件位置+1]+ “>Sequence_X_PaireEnd.fastq” 操作系统（命令）

这最后一个命令被彻底地覆盖了

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只有当您使用Python获取文件列表时，这才是最好的。如果文件列表来自其他地方，那么几乎可以肯定，最好在命令shell中编写脚本：bash。

请使用代码块而不是引号块。另外，请提供一个具体的示例，说明将为一组具体的示例文件运行哪些命令。这是命令行吗？如果是windows，您可以尝试使用[shell]或[bash]或[batch]标记问题。在这样的级别上，对这样的文件“运行命令”要容易得多。