Python 无openCV的目标跟踪

我试图建立一个算法来检测一些物体，并随着时间的推移跟踪它们。我的输入数据是一个tif多堆栈文件，我将其读取为

np

数组。我应用U-Net模型创建一个二进制掩码，然后使用

scipy

识别单个对象的坐标

到目前为止，一切都很顺利，但我就是无法集中精力进行跟踪。我有一个字典，其中键是帧编号，值是元组列表。每个元组包含每个对象的坐标

现在我必须将这些对象链接在一起，这在纸上看起来很简单。我希望有一个函数或包可以这样做（理想情况下类似于

trackMate

或

ImageJ

上的M2track），但我找不到类似的东西。我正在考虑编写我自己的近邻工具，但我想知道是否有一种不那么痛苦的方法（而且，我也想考虑更高级的度量）。

我考虑的另一个选项是使用

cv2

，但这需要将数据转换为

cv2

喜欢的格式，这将大大降低代码的速度。此外，我希望使数据尽可能接近原始输入，因此对我来说没有

cv2

。

我使用trackpy解决了它。

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trackpy可以正确读取多堆栈tiff文件（OpenCv不能）。

OpenCv对Numpy阵列很满意&如果您使用的是SciPy，那么我猜您已经在使用Numpy阵列了？