Python R CMD javareconf-e有更好的解决方案吗？

我目前正在从事一个项目，该项目旨在提供一个应用程序供普通人使用——只运行已实现的功能和算法——并且易于扩展，以便帮助其他研究人员使用“只需在此处插入额外代码”的体系结构

我使用的是Electron Python后端，它还使用rpy2库与R进行通信。 问题是，我的Python代码需要加载的一个R库使用了rJava，而我发现使语法

rpackages.importr（'rJava'）

工作的唯一方法是，在运行Python脚本之前，使用命令

R CMD javareconf-e

，导出一些R/Java变量（我认为它会这样做），然后它在Ubuntu上运行良好

我也在Windows上简要测试了这个解决方案，但它不起作用。所以我想知道，如果有其他方法，我该如何解决这个问题

在Linux场景中，您认为在R CMD命令之前运行npm start（对于整个Electron应用程序）是否可行？难道没有更好的解决办法吗

我也在考虑使用Docker容器，但我担心这会使其他研究人员更难将代码插入应用程序（例如，如果需要外部库）

未使用

R CMD javareconf-e

的错误如下：

...............
  File "/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/rpy2/robjects/packages.py", line 483, in importr
    env = _get_namespace(name)
  File "/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/rpy2/rinterface_lib/conversion.py", line 40, in _
    cdata = function(*args, **kwargs)
  File "/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/rpy2/rinterface.py", line 791, in __call__
    raise embedded.RRuntimeError(_rinterface._geterrmessage())
rpy2.rinterface_lib.embedded.RRuntimeError: Error: .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/home/thispc/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/rJava/libs/rJava.so':
  libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory

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我已经试过了

~$sudo R CMD javareconf

R似乎安装在一个非常规的位置。可能链接器找不到它。按照以下命令输出中的建议设置环境变量是否有帮助

python -m rpy2.situation LD_LIBRARY_PATH

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R似乎安装在一个非传统的位置。可能链接器找不到它。按照以下命令输出中的建议设置环境变量是否有帮助

python -m rpy2.situation LD_LIBRARY_PATH

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lang js R CMD javareconf-e

不能在Windows上使用。解决方案还克服了错误消息@Collombelli提到：

rpy2.robjects.packages.LibraryError:包“rJava”中的symbol.env与Python对象属性冲突

代码如下：

rJava=importr（'rJava'，robject\u translations={.env'：'uu\u env'}）

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M Sellwood的信用卡不能在Windows上使用。解决方案还克服了错误消息@Collombelli提到：

rpy2.robjects.packages.LibraryError:包“rJava”中的symbol.env与Python对象属性冲突

代码如下：

rJava=importr（'rJava'，robject\u translations={.env'：'uu\u env'}）

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使用命令

~$python3-mrpy2.situation LD_LIBRARY_PATH

可以得到以下输出：

/usr/lib/R/lib:/usr/lib/x86\u 64-linux-gnu:/usr/lib/jvm/default java/lib/server

，但它没有解决问题。我认为这与R/Java有关，因为其他软件包加载得很好。您是否运行了

export LD_LIBRARY\u PATH=/usr/lib/R/lib:/usr/lib/x86\u 64-linux-gnu:/usr/lib/jvm/default Java/lib/server

来设置Python+rpy2将运行的环境？（在启动python之前，在同一个shell中运行

export…

）。好的，我运行了

~$export LD_LIBRARY\u PATH=/usr/lib/R/lib:/usr/lib/x86\u 64-linux-gnu:/usr/lib/jvm/default java/lib/server

然后启动了一个python3 shell并尝试导入rJava:

>导入rpy2.robjects.packages作为rpackages

>rpackages.importr（'rJava'）

结果：（一些回溯错误和…）`raise LibraryError（'symbol'+rname+rpy2.robjects.packages.LibraryError:package“rJava”中的symbol.env'与Python对象属性“使用命令

~$python3-m rpy2”冲突。情况LD_LIBRARY\u PATH

给出以下输出：

/usr/lib/R/lib:/usr/lib/x86\u 64-linux-gnu:/usr/lib/jvm/default java/lib/server

，但它没有解决问题。我认为这是R/java的问题，因为其他包加载得很好。是吗您可以运行

export-LD\u-LIBRARY\u-PATH=/usr/lib/R/lib:/usr/lib/x86\u 64-linux-gnu:/usr/lib/jvm/default-java/lib/server

来设置Python+rpy2将在其中运行的环境（在启动Python之前，在同一个shell中运行

export…

）哦，对不起。好的，我运行了

~$export LD_LIBRARY\u PATH=/usr/lib/R/lib:/usr/lib/x86\u 64-linux-gnu:/usr/lib/jvm/default java/lib/server

然后启动了一个python3 shell并尝试导入rJava:

>>将rpy2.robjects.packages导入为rpackages

>rpackages.importr（'rJava'）

结果：（一些回溯错误和…）`raise LibraryError（'symbol'+rname+rpy2.robjects.packages.LibraryError:包“rJava”中的symbol.env与Python对象属性冲突`